Linux下载GEO数据,教你3种方法下载NCBI GEO数据

好的，下面是三种下载NCBI GEO数据的方法：

方法一：使用wget命令下载GEO数据

1. 打开NCBI GEO网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）；
2. 在搜索框中输入GEO数据的ID，如GSE12345；
3. 在搜索结果页面中点击“FTP”按钮，进入FTP页面；
4. 复制FTP链接，如ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE12nnn/GSE12345/suppl/GSE12345_RAW.tar；
5. 在Linux终端中输入wget命令下载数据，如：wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE12nnn/GSE12345/suppl/GSE12345_RAW.tar。

方法二：使用rsync命令下载GEO数据

1. 打开NCBI GEO网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）；
2. 在搜索框中输入GEO数据的ID，如GSE12345；
3. 在搜索结果页面中点击“FTP”按钮，进入FTP页面；
4. 复制FTP链接，如ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE12nnn/GSE12345/suppl/GSE12345_RAW.tar；
5. 在Linux终端中输入rsync命令下载数据，如：rsync -avP rsync://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE12nnn/GSE12345/suppl/GSE12345_RAW.tar .

方法三：使用Aspera Connect下载GEO数据

1. 打开NCBI GEO网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）；
2. 在搜索框中输入GEO数据的ID，如GSE12345；
3. 在搜索结果页面中点击“FTP”按钮，进入FTP页面；
4. 点击“Aspera Connect”按钮，下载并安装Aspera Connect客户端；
5. 在Linux终端中输入ascp命令下载数据，如：ascp -QT -l 300m -P 33001 -i /path/to/aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-connect://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE12nnn/GSE12345/suppl/GSE12345_RAW.tar .。

以上是三种下载NCBI GEO数据的方法，希望能帮到您。