利用pandas选取excel的两行样本数据并且计算样本间的样本相异度欧氏距离,最后通过颜色饱和度可视化八个样本之间的相异度
时间: 2024-02-24 20:53:16 浏览: 123
好的,我来为您解答这个问题。
首先,我们需要使用 Pandas 库来选取 Excel 文件中的两行样本数据。假设我们已经读取了 Excel 文件,并将数据保存在名为 `df` 的 DataFrame 中,我们可以使用 `.iloc` 方法来选取第一行和第二行数据,代码如下:
```python
sample1 = df.iloc[0]
sample2 = df.iloc[1]
```
接下来,我们可以使用 Scipy 库中的 `euclidean()` 函数来计算这两个样本之间的欧氏距离,代码如下:
```python
from scipy.spatial.distance import euclidean
distance = euclidean(sample1, sample2)
```
现在,我们已经得到了这两个样本之间的距离,接下来我们需要计算所有样本之间的距离。我们可以使用循环来实现这一点,但是这样会比较繁琐。因此,我们可以使用 Scikit-learn 库中的 `pairwise_distances()` 函数来计算所有样本之间的距离,代码如下:
```python
from sklearn.metrics import pairwise_distances
dist_matrix = pairwise_distances(df, metric='euclidean')
```
最后,我们可以将这个距离矩阵可视化出来。为了达到可视化的目的,我们需要将距离矩阵进行归一化,然后通过颜色饱和度的变化来表示距离的大小。代码如下:
```python
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
# 将距离矩阵进行归一化
norm_dist_matrix = dist_matrix / np.max(dist_matrix)
# 用矩阵来可视化距离
plt.imshow(norm_dist_matrix, cmap='hot', interpolation='nearest')
plt.colorbar()
plt.show()
```
这样,我们就可以将八个样本之间的相异度通过颜色饱和度可视化出来了。
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