用pandas计算有样本编号的八行数据两两之间的余弦相似度,且利用颜色饱和度可视化样本间的余弦相似度

时间: 2024-02-20 16:00:09 浏览: 23
可以按照以下步骤进行操作: 1. 首先导入 pandas、numpy 和 seaborn 库: ```python import pandas as pd import numpy as np import seaborn as sns ``` 2. 创建一个包含样本编号和数据的 DataFrame: ```python data = pd.DataFrame({'SampleID': ['S1', 'S2', 'S3', 'S4', 'S5', 'S6', 'S7', 'S8'], 'Data1': [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8], 'Data2': [8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1]}) ``` 3. 将 DataFrame 中的数据转换为 numpy 数组并计算余弦相似度: ```python from sklearn.metrics.pairwise import cosine_similarity from itertools import combinations sample_ids = data['SampleID'] data_values = data.drop('SampleID', axis=1).values combs = combinations(range(len(sample_ids)), 2) cos_sim = [cosine_similarity([data_values[i]], [data_values[j]])[0][0] for i, j in combs] cos_sim_df = pd.DataFrame({'SampleID1': [sample_ids[i] for i, _ in combs], 'SampleID2': [sample_ids[j] for _, j in combs], 'CosineSimilarity': cos_sim}) ``` 4. 使用 seaborn 库绘制颜色饱和度可视化图: ```python cos_sim_matrix = cos_sim_df.pivot(index='SampleID1', columns='SampleID2', values='CosineSimilarity') sns.set(style='white') cmap = sns.diverging_palette(220, 10, as_cmap=True) sns.heatmap(cos_sim_matrix, annot=True, cmap=cmap, vmin=-1, vmax=1, center=0, square=True) ``` 这样可以绘制出样本间余弦相似度的颜色饱和度可视化图。

相关推荐

最新推荐

recommend-type

用Pandas和Folium做一个新冠数据可视化

目录数据集介绍可视化步骤1. 导入pandas等需要的库2. 读取数据,查看基本情况3. 读取城市坐标数据4. 按省份统计人数5. 合并城市坐标数据 与 省份数据6. 绘制地图写入HTML文件,并用浏览器打开完整代码 数据集介绍 1...
recommend-type

(二)爬取新房销售信息——数据分析+可视化篇

pandas & matplotlib 用于数据分析和可视化 上一个任务通过requests、BeautifulSoup4两个功能强大、用法简洁的函数库已经获取到了楼盘名、地址和价格这些新房信息,并且保存为csv格式文件,csv文件可以用excel打开并...
recommend-type

利用pandas向一个csv文件追加写入数据的实现示例

我们越来越多的使用pandas进行数据处理,有时需要向一个已经存在的csv文件写入数据,传统的方法之前我也有些过,向txt,excel文件写入数据,传送门:Python将二维列表(list)的数据输出(TXT,Excel) pandas to_...
recommend-type

使用Python Pandas处理亿级数据的方法

主要介绍了使用Python Pandas处理亿级数据的方法,小编觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。一起跟随小编过来看看吧
recommend-type

使用Python(pandas库)处理csv数据

(注:本文写于做毕设期间,有处理大量csv文件的需要,故使用python强大的库资源来处理数据,希望对有需要的你提供帮助和启发) 使用Python(pandas)处理数据 原始数据和处理之后的样式 图中为一个csv文件,待处理的...
recommend-type

zigbee-cluster-library-specification

最新的zigbee-cluster-library-specification说明文档。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

【实战演练】MATLAB用遗传算法改进粒子群GA-PSO算法

![MATLAB智能算法合集](https://static.fuxi.netease.com/fuxi-official/web/20221101/83f465753fd49c41536a5640367d4340.jpg) # 2.1 遗传算法的原理和实现 遗传算法(GA)是一种受生物进化过程启发的优化算法。它通过模拟自然选择和遗传机制来搜索最优解。 **2.1.1 遗传算法的编码和解码** 编码是将问题空间中的解表示为二进制字符串或其他数据结构的过程。解码是将编码的解转换为问题空间中的实际解的过程。常见的编码方法包括二进制编码、实数编码和树形编码。 **2.1.2 遗传算法的交叉和
recommend-type

openstack的20种接口有哪些

以下是OpenStack的20种API接口: 1. Identity (Keystone) API 2. Compute (Nova) API 3. Networking (Neutron) API 4. Block Storage (Cinder) API 5. Object Storage (Swift) API 6. Image (Glance) API 7. Telemetry (Ceilometer) API 8. Orchestration (Heat) API 9. Database (Trove) API 10. Bare Metal (Ironic) API 11. DNS
recommend-type

JSBSim Reference Manual

JSBSim参考手册,其中包含JSBSim简介,JSBSim配置文件xml的编写语法,编程手册以及一些应用实例等。其中有部分内容还没有写完,估计有生之年很难看到完整版了,但是内容还是很有参考价值的。