library(glmnet) library(foreign) y<-as.matrix(data[,38]) x<-as.matrix(data[,c(4:37)]) f1 = glmnet(x, y, family="gaussian", nlambda=100, alpha=1) #这里alpha=1为LASSO回归,如果等于0就是岭回归 #参数 family 规定了回归模型的类型: #family="gaussian" 适用于一维连续因变量(univariate) #family="mgaussian" 适用于多维连续因变量(multivariate) #family="poisson" 适用于非负次数因变量(count) #family="binomial" 适用于二元离散因变量(binary) #family="multinomial" 适用于多元离散因变量(category) #我们这里结局指标是连续因变量,所以使用gaussian print(f1)#把f1结果输出 plot(f1, xvar="lambda", label=TRUE) coef(f1,s=0.1) cvfit = cv.glmnet(x, y, type.measure = "mse", nfolds = 5) plot(cvfit)
时间: 2024-03-24 19:36:52 浏览: 11
这段代码的目的是进行LASSO回归分析,并使用交叉验证来优化模型。但是,在运行这段代码时,你可能会遇到以下错误信息:
```
Error in glmnet(x, y, family = "gaussian", nlambda = 100, alpha = 1) :
x should be a numeric matrix
```
这个错误的原因是在将数据转换为矩阵时,数据类型不匹配。具体地说,可能是`data[, 38]`和`data[, c(4:37)]`中的某些列包含非数值数据。这可能是由于数据集中存在缺失值或非数值数据,或者在读取数据时出现了错误。
为了解决这个问题,你可以执行以下操作:
1. 检查数据集,确保没有缺失值或非数值数据。
2. 如果数据集中包含缺失值,你可以使用`na.omit()`函数来删除包含缺失值的行,或者使用`na.replace()`函数来替换缺失值。
3. 如果数据集中包含非数值数据,你可以使用`as.numeric()`或`as.matrix()`函数将其转换为数值数据。
4. 如果读取数据时出现了错误,你可以检查数据文件的格式是否正确,或者使用不同的读取数据的函数来读取数据,如`read.csv()`。
如果你确认数据类型已经正确,可以尝试重新运行代码,并查看是否仍然出现同样的错误。
相关问题
在运行以下代码时:data <- matrix(rnorm(50*30), nrow = 50) X <- data[,1:29] Y <- data[,30] fit <- lm(Y ~ X) library(boot) cv.fit <- cv.glm(data, fit, K = 10) cv.error <- cv.fit$delta library(glmnet) cv.ridge <- cv.glmnet(X, Y, alpha = 0, nfolds = 10) plot(cv.ridge)。发生错误:Error in model.frame.default(formula = Y ~ X, data = c(-0.247905852710355, : 'data'必需是数据框, 不能是矩阵或陣列。请在不会发生其他错误的前提下修正原代码
错误提示说明`cv.glmnet`函数中的输入数据必须是数据框,不能是矩阵或数组。因此,可以使用`as.data.frame()`函数将`X`和`Y`转换成数据框,然后再输入到`cv.glmnet`函数中。修改后的代码如下:
```
data <- matrix(rnorm(50*30), nrow = 50)
X <- data[,1:29]
Y <- data[,30]
fit <- lm(Y ~ X)
library(boot)
cv.fit <- cv.glm(as.data.frame(data), fit, K = 10)
cv.error <- cv.fit$delta
library(glmnet)
cv.ridge <- cv.glmnet(as.data.frame(X), as.data.frame(Y), alpha = 0, nfolds = 10)
plot(cv.ridge)
```
在这个修改后的代码中,我们使用`as.data.frame()`函数将`data`转换成数据框,并将其输入到`cv.glm`函数中。同时,我们还使用`as.data.frame()`函数将`X`和`Y`转换成数据框,并将其输入到`cv.glmnet`函数中。这样就能够顺利运行并得到岭回归下的曲线图了。
请用测试集训练集的写法,改写以下代码:library(caret) ctrl <- trainControl(method="cv",number=5) model1 <- train(data,y1,method="lm",trControl=ctrl) model2 <- train(data,y2,method="lm",trControl=ctrl) model3 <- train(data,y3,method="lm",trControl=ctrl) cv1 <- model1$results$RMSE cv2 <- model2$results$RMSE cv3 <- model3$results$RMSE set.seed(123) library(glmnet) x <- model.matrix(~.,data) y <- y1 # y2 或 y3 ridge1 <- cv.glmnet(x,y,alpha=0) ridge2 <- cv.glmnet(x,y,alpha=0) ridge3 <- cv.glmnet(x,y,alpha=0) plot(ridge1) plot(ridge2) plot(ridge3) set.seed(123) upper_bound <- mean(y1) + sd(y1)
以下是使用测试集训练集的代码:
```{r}
set.seed(123)
library(caret)
trainIndex <- createDataPartition(y1, p=0.8, list=FALSE)
data_train <- data[trainIndex,]
data_test <- data[-trainIndex,]
y1_train <- y1[trainIndex]
y1_test <- y1[-trainIndex]
y2_train <- y2[trainIndex]
y2_test <- y2[-trainIndex]
y3_train <- y3[trainIndex]
y3_test <- y3[-trainIndex]
ctrl <- trainControl(method="cv", number=5)
model1 <- train(data_train, y1_train, method="lm", trControl=ctrl)
model2 <- train(data_train, y2_train, method="lm", trControl=ctrl)
model3 <- train(data_train, y3_train, method="lm", trControl=ctrl)
cv1 <- sqrt(mean((predict(model1, data_test) - y1_test)^2))
cv2 <- sqrt(mean((predict(model2, data_test) - y2_test)^2))
cv3 <- sqrt(mean((predict(model3, data_test) - y3_test)^2))
set.seed(123)
library(glmnet)
x <- model.matrix(~., data_train)
y <- y1_train
ridge1 <- cv.glmnet(x, y, alpha=0, nfolds=5)
y <- y2_train
ridge2 <- cv.glmnet(x, y, alpha=0, nfolds=5)
y <- y3_train
ridge3 <- cv.glmnet(x, y, alpha=0, nfolds=5)
plot(ridge1)
plot(ridge2)
plot(ridge3)
set.seed(123)
upper_bound <- mean(y1_train) + sd(y1_train)
```