prediction <- function(fdat,fmod,nstates) { XX <-cbind(1,(fdat[,c("time","time2")])) nb <- ncol(XX) nt <- nrow(XX) B1 = array(0,c(nb,nstates)) for( j in 1:nstates ){ b1 = fmod@response[[j]][[1]] B1[,j] <- c(b1@parameters$coefficients) } yy1 <- as.matrix(XX)%*%B1 yy1[yy1 < 0] <- 0 pst_new <- posterior(fmod,type="viterbi") predict <- rep(0,nt) for(i in 1:nrow(pst_new)) { predict[i] <- yy1[i,pst_new[i,"state"]] predict[i] <- max(yy1[i,]) } if(nt > nrow(pst_new)) { for(i in (nrow(pst_new)+1):nt) predict[i] <- max(0,max(yy1[i,])) } ret<- cbind(predict,yy1) colnames(ret) <- c("predict","mean1","mean2") ret }
时间: 2024-04-04 16:33:33 浏览: 16
这是一个用 R 语言实现的函数,名为 prediction。它的输入包括三个参数:
- fdat:数据框,包含待预测的时间序列数据。
- fmod:HMM 模型对象,包含已经训练好的模型参数。
- nstates:整数,表示 HMM 模型中隐藏状态的个数。
该函数的主要功能是根据输入的数据和模型参数进行预测,返回一个包含预测值、每个状态对应的均值等信息的数据框。具体而言,该函数首先将输入数据转化为矩阵 XX,然后根据模型参数计算出每个状态下的观测值的均值,存储在矩阵 B1 中。接着,函数根据 Viterbi 算法计算出每个时间点最可能的隐藏状态,存储在矩阵 pst_new 中。然后函数利用 XX 和 B1 计算出每个时间点下,各个状态的预测值,存储在矩阵 yy1 中。最后,函数将 yy1 中每个时间点对应的最大预测值作为该时间点的预测结果,存储在向量 predict 中,并返回一个包含预测值、每个状态对应的均值等信息的数据框 ret。
相关问题
prediction <- paste(prediction, collapse = ",")
这段代码将一个向量 `prediction` 中的元素连接成一个字符串,并使用逗号作为元素之间的分隔符。
`paste()` 函数在 R 中用于连接多个字符串。通过设置 `collapse` 参数为 `,`,我们可以指定以逗号作为分隔符来连接字符串。
以下是一个示例代码:
```R
prediction <- c("apple", "banana", "orange")
prediction_string <- paste(prediction, collapse = ",")
print(prediction_string)
```
输出结果为:
```
"apple,banana,orange"
```
在这里,我们创建了一个包含三个元素的向量 `prediction`。然后,使用 `paste()` 函数将这些元素连接成一个字符串,并使用逗号作为分隔符。最后,我们打印输出这个连接后的字符串 `prediction_string`。
请注意,`paste()` 函数也可以接受其他参数来定制连接后的字符串的格式。你可以参考 R 的帮助文档,了解更多关于 `paste()` 函数的用法和参数选项。
基于以下代码:# ①建立50×30的随机数据和30个变量 set.seed(123) X <- matrix(rnorm(50*30), ncol=30) y <- rnorm(50) # ②生成三组不同系数的线性模型 beta1 <- rnorm(30, mean=1, sd=0.5) beta2 <- rnorm(30, mean=2, sd=0.5) beta3 <- rnorm(30, mean=3, sd=0.5) # 定义一个函数用于计算线性回归的CV值 cv_linear <- function(X, y, k=10, lambda=NULL) { n <- nrow(X) if (is.null(lambda)) { lambda <- seq(0, 1, length.out=100) } mse <- rep(0, length(lambda)) folds <- sample(rep(1:k, length.out=n)) for (i in 1:k) { X_train <- X[folds!=i, ] y_train <- y[folds!=i] X_test <- X[folds==i, ] y_test <- y[folds==i] for (j in 1:length(lambda)) { fit <- glmnet(X_train, y_train, alpha=0, lambda=lambda[j]) y_pred <- predict(fit, newx=X_test) mse[j] <- mse[j] + mean((y_test - y_pred)^2) } } mse <- mse / k return(mse) } # ③(线性回归中)分别计算这三组的CV值 lambda <- seq(0, 1, length.out=100) mse1 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda) mse2 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda) mse3 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda) # ④(岭回归中)分别画出这三组的两张图,两张图均以lambd为横坐标,一张图以CV error为纵坐标,一张图以Prediction error为纵坐标,两张图同分开在Plots位置 library(glmnet) par(mfrow=c(1,2)) # 画CV error图 plot(lambda, mse1, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta1") points(lambda, mse2, type="l", col="red") points(lambda, mse3, type="l", col="blue") # 画Prediction error图 fit1 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse1)]) fit2 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse2)]) fit3 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse3)]) y_pred1 <- predict(fit1, newx=X) y_pred2 <- predict(fit2, newx=X) y_pred3 <- predict(fit3, newx=X) pred_error1 <- mean((y - y_pred1)^2) pred_error2 <- mean((y - y_pred2)^2) pred_error3 <- mean((y - y_pred3)^2) plot(lambda, pred_error1, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta1") points(lambda, pred_error2, type="l", col="red") points(lambda, pred_error3, type="l", col="blue")。按以下要求修改R代码:将三组的分别以CV error和Prediction error为纵坐标的图,每次Plots位置只会出现同一个组的两张分别以CV error和Prediction error为纵坐标的图
可以按照以下步骤修改代码:
1. 将 par(mfrow=c(1,2)) 改为 par(mfrow=c(2,3)),表示将Plots位置改为6个。
2. 将 plot(lambda, mse1, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta1") 和 plot(lambda, pred_error1, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta1") 改为:
```
# 画Beta1的CV error图
plot(lambda, mse1, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta1 CV error")
# 画Beta1的Prediction error图
plot(lambda, pred_error1, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta1 Prediction error")
```
这样就能够将同一组的两张图排列在一起,并且更明确地表示出它们的含义。
3. 将上述代码中的“Beta1”改为“Beta2”和“Beta3”,分别表示三组系数的图像。修改后的完整代码如下:
```
# ①建立50×30的随机数据和30个变量
set.seed(123)
X <- matrix(rnorm(50*30), ncol=30)
y <- rnorm(50)
# ②生成三组不同系数的线性模型
beta1 <- rnorm(30, mean=1, sd=0.5)
beta2 <- rnorm(30, mean=2, sd=0.5)
beta3 <- rnorm(30, mean=3, sd=0.5)
# 定义一个函数用于计算线性回归的CV值
cv_linear <- function(X, y, k=10, lambda=NULL) {
n <- nrow(X)
if (is.null(lambda)) {
lambda <- seq(0, 1, length.out=100)
}
mse <- rep(0, length(lambda))
folds <- sample(rep(1:k, length.out=n))
for (i in 1:k) {
X_train <- X[folds!=i, ]
y_train <- y[folds!=i]
X_test <- X[folds==i, ]
y_test <- y[folds==i]
for (j in 1:length(lambda)) {
fit <- glmnet(X_train, y_train, alpha=0, lambda=lambda[j])
y_pred <- predict(fit, newx=X_test)
mse[j] <- mse[j] + mean((y_test - y_pred)^2)
}
}
mse <- mse / k
return(mse)
}
# ③(线性回归中)分别计算这三组的CV值
lambda <- seq(0, 1, length.out=100)
mse1 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda)
mse2 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda)
mse3 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda)
# ④(岭回归中)分别画出这三组的两张图,每组两张图均以lambda为横坐标:
library(glmnet)
par(mfrow=c(2,3))
# 画Beta1的CV error图
plot(lambda, mse1, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta1 CV error")
# 画Beta1的Prediction error图
fit1 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse1)])
y_pred1 <- predict(fit1, newx=X)
pred_error1 <- mean((y - y_pred1)^2)
plot(lambda, pred_error1, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta1 Prediction error")
# 画Beta2的CV error图
plot(lambda, mse2, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta2 CV error")
# 画Beta2的Prediction error图
fit2 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse2)])
y_pred2 <- predict(fit2, newx=X)
pred_error2 <- mean((y - y_pred2)^2)
plot(lambda, pred_error2, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta2 Prediction error")
# 画Beta3的CV error图
plot(lambda, mse3, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta3 CV error")
# 画Beta3的Prediction error图
fit3 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse3)])
y_pred3 <- predict(fit3, newx=X)
pred_error3 <- mean((y - y_pred3)^2)
plot(lambda, pred_error3, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta3 Prediction error")
```