deepchem怎么安装
时间: 2023-12-13 07:02:53 浏览: 100
你可以按照以下步骤安装DeepChem:
1. 确保你已经安装了Python 3和pip。
2. 打开终端或命令提示符,输入以下命令安装DeepChem:
```
pip install --pre deepchem
```
3. 如果你想使用GPU加速,你需要先安装CUDA和cuDNN,并且确保你的GPU支持CUDA。
4. 如果你想使用RDKit,你需要先安装RDKit。你可以使用以下命令安装:
```
conda install -c rdkit rdkit
```
或者
```
pip install rdkit-pypi
```
5. 安装完成后,你可以在Python脚本或Jupyter Notebook中导入DeepChem并开始使用它:
```python
import deepchem as dc
```
希望这能帮到你!
相关问题
ubuntu安装DeepChem
要在Ubuntu上安装DeepChem,你可以按照以下步骤进行操作:
1. 下载DeepChem的安装包。你可以从DeepChem的官方网站上下载最新的稳定版本。根据你的系统和需求选择合适的版本。
2. 解压下载的安装包。你可以将其解压到一个你想要安装DeepChem的目录中。
3. 打开终端,并导航到解压后的DeepChem目录。你可以使用cd命令切换到相应的目录。例如,如果你的DeepChem安装目录是/home/ubuntu/wufeil/Deepchem-RDKit/Autodock_Vina/,你可以使用以下命令切换到该目录: cd /home/ubuntu/wufeil/Deepchem-RDKit/Autodock_Vina/。
4. 安装DeepChem的依赖项。DeepChem的安装包通常会附带一个requirements.txt文件,其中包含了需要的依赖库和版本。你可以使用pip或conda根据requirements.txt文件来安装这些依赖项。
5. 安装完成后,你可以尝试导入DeepChem并运行一些示例代码来验证安装是否成功。你可以在DeepChem的文档或示例代码中找到一些用于测试的示例。
请注意,上述步骤仅提供了一般的安装指南,具体的安装过程可能会因你的系统配置和DeepChem的版本而有所不同。建议你在安装之前仔细阅读DeepChem的文档,并遵循官方提供的安装步骤。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* *3* [使用Autodock Vina进行分子对接](https://blog.csdn.net/wufeil7/article/details/121964144)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 100%"]
[ .reference_list ]
ubuntu安装deepchem
要在Ubuntu上安装DeepChem,您可以按照以下步骤进行操作:
1. 首先,您需要下载MGLtools安装包。您可以从https://ccsb.scripps.edu/mgltools/downloads/ 下载mgltools_x86_64Linux2_1.5.7.tar.gz (Linux 64 tarball installer 108Mb)安装包。\[3\]
2. 下载完成后,解压缩安装包并进入解压后的目录。
3. 打开终端,并使用sudo权限编辑~/.bashrc文件,添加以下内容来设置环境变量和别名:
```
export PATH=/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin:$PATH
alias pmv='/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/pmv'
alias adt='/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/adt'
alias vision='/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/vision'
alias pythonsh='/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/pythonsh'
```
请将上述命令中的`/path/to/`替换为您解压缩MGLtools安装包的路径。\[1\]
4. 编辑DeepChem的启动脚本,将第一行替换为:
```
#!/usr/bin/env /path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/python
```
同样,请将上述命令中的`/path/to/`替换为您解压缩MGLtools安装包的路径。\[2\]
5. 保存并关闭~/.bashrc文件。
6. 在终端中运行以下命令使更改生效:
```
source ~/.bashrc
```
现在,您应该已经成功安装了DeepChem。您可以在终端中运行相关命令来使用DeepChem进行分子计算和化学模拟。
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* *3* [使用Autodock Vina进行分子对接](https://blog.csdn.net/wufeil7/article/details/121964144)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
[ .reference_list ]