id与第一个碱基被和到一起了，需要分开

你可以将这行代码：

output.append([current_id] + current_seq)

修改为：

output.append([current_id] + [' '.join(current_seq)])

这样在生成的 csv 文件中，每个碱基之间会用一个空格分隔开来，而不是用逗号分隔。

相关问题

id与第一个碱基被分到一列了 需要分开

你可以将这行代码：

output.append([current_id] + [' '.join(current_seq)])

修改为：

output.append([current_id] + current_seq)

然后再添加一行代码：

output[-1][1] = ' '.join(output[-1][1].split()[1:])

这样就可以将 id 和第一个碱基分开了。具体来说，第一次添加序列信息到输出列表时，序列信息是一个列表，其中的每个元素是形如 "A, T, G, C" 的字符串，我们需要将这些字符串合并成一个字符串，并用空格分隔每个碱基。在添加完成后，我们可以通过 `split()` 函数将这个字符串按空格分割成一个字符串列表，然后将列表的第一个元素删除，最后再将剩余元素重新合并成一个字符串，就可以得到只包含碱基信息的字符串了。

第一个碱基和id在一列 需要分开

如果你需要将每个 DNA 序列的 ID 和第一个碱基分开显示，只需要在输出时将它们分别加入到输出列表中即可。以下是修改后的代码：

import csv

# 读取FASTA文件
with open('input.fasta', 'r') as f:
    lines = f.readlines()

# 初始化变量 output
output = [['id', '1']]

current_id = ''
current_seq = []

# 循环遍历所有行
for line in lines:
    # 如果是一个新的序列的id行
    if line.startswith('>'):
        # 如果之前已经读取了一个序列的id和序列
        if current_id != '':
            # 将当前的id和序列添加到输出列表中
            output.append([current_id, current_seq[0]])

        # 重置当前id和序列
        current_id = ''
        current_seq = []

        # 获取新的序列的id
        current_id = line.strip()[1:]
    # 如果是一个序列行
    else:
        # 将碱基一个一个地添加到列表中
        nucleotides = list(line.strip())
        current_seq += nucleotides

# 将最后一个序列添加到输出列表中
output.append([current_id, current_seq[0]])

# 将输出列表写入到csv文件中
with open('output.csv', 'w', newline='') as f:
    writer = csv.writer(f, delimiter=',', quoting=csv.QUOTE_NONE)
    writer.writerows(output)

在输出列表中，我们增加了一列名为 `1` 的列，用于显示每个 DNA 序列的第一个碱基。在循环中，我们将每个 DNA 序列的 ID 和第一个碱基分别添加到输出列表中。在写入 CSV 文件时，输出列表中的每个子列表都会被写入一行。