Trinity --seqType fq --max_memory 70G --single ${Fastq_Name} --CPU 24里 --cpu24是啥
时间: 2023-08-25 15:16:51 浏览: 141
24数源码:给您4个数字,不论您如何计算,您能计算得到24吗?
"--CPU 24"指的是Trinity软件运行时使用的CPU核心数。在这个命令中,Trinity软件使用了24个CPU核心来处理输入的FASTQ文件,这可以提高Trinity软件的运行效率和处理速度。
Trinity是一个RNA-Seq数据的组装软件,用于从RNA-Seq数据中重建转录本和基因表达量。"--seqType fq"指的是输入的数据类型为FASTQ格式,"--max_memory 70G"指定了Trinity软件可以使用的最大内存为70G,"--single ${Fastq_Name}"指定了输入的FASTQ文件名,该文件只含有单端序列数据。
阅读全文