def findSOPs(path): dcmFileNames = os.listdir(path) cuts = [] SOPs = [] for dcmFileName in dcmFileNames: if 'CT.' in dcmFileName: dcmFileName = path+'\\'+dcmFileName dcmFileNames = list(map(str,dcmFileName.split("."))) #print(dcmFileNames) cut = re.findall("\d+",dcmFileNames[2]) ds = pydicom.dcmread(dcmFileName) SOPs.append(ds.SOPInstanceUID) cuts.append(int(cut[0])) cuts = np.array(cuts) #print(np.sort(cuts)) #cuts_index = cuts.argsort() SOPs = np.array(SOPs) SOPs = SOPs[np.argsort(cuts)] SOPs = SOPs.tolist() #print(SOPs) return SOPs
时间: 2023-12-20 17:06:13 浏览: 35
这段代码是用来读取目录下所有 CT 格式的 DICOM 文件,并返回每个文件的 SOPInstanceUID。具体来说,它首先使用 os.listdir() 函数列出给定目录下所有文件的文件名,并遍历这些文件名。如果文件名中包含 'CT.',则说明该文件是一个 CT 格式的 DICOM 文件,将其读入内存。然后使用正则表达式 \d+ 提取文件名中的数字,这些数字表示该 CT 图像所在的层数。将这些层数和对应的 SOPInstanceUID 存储在 cuts 和 SOPs 两个列表中。最后,根据层数对 SOPInstanceUID 进行排序,返回排序后的 SOPInstanceUID 列表。
相关问题
# 目录下某CT文件的SOP值 def findSOPs(path): dcmFileNames = os.listdir(path) cuts = [] SOPs = [] for dcmFileName in dcmFileNames: if 'CT.' in dcmFileName: dcmFileName = path+'\\'+dcmFileName dcmFileNames = list(map(str,dcmFileName.split("."))) #print(dcmFileNames) cut = re.findall("\d+",dcmFileNames[2]) ds = pydicom.dcmread(dcmFileName) SOPs.append(ds.SOPInstanceUID) cuts.append(int(cut[0])) cuts = np.array(cuts) #print(np.sort(cuts)) #cuts_index = cuts.argsort() SOPs = np.array(SOPs) SOPs = SOPs[np.argsort(cuts)] SOPs = SOPs.tolist() #print(SOPs) return SOPs
这段代码实现了一个函数,用于获取某个目录下某个CT文件的SOPInstanceUID值。该函数接受一个参数path,表示目录的路径。
该函数的主要实现过程如下:
1.使用os.listdir方法获取目录下所有文件的文件名,存储在dcmFileNames数组中。
2.遍历dcmFileNames数组,如果发现文件名中包含“CT.”,则将其作为CT文件进行处理。
3.使用pydicom.dcmread方法读取CT文件,获取其SOPInstanceUID值,并将其存储在SOPs数组中。
4.使用正则表达式从文件名中提取出CT文件对应的切片数值,并将其存储在cuts数组中。
5.将cuts数组按升序排列,并将SOPs数组按照cuts数组的顺序重新排序,得到一个按照切片顺序排列的SOPInstanceUID值列表。
6.将SOPs转换为Python列表,并返回。
def findSOPs(path): dcmFileNames = os.listdir(path) cuts = [] SOPs = [] for dcmFileName in dcmFileNames: if 'CT.' in dcmFileName: dcmFileName = path+'\\'+dcmFileName dcmFileNames = list(map(str,dcmFileName.split("."))) #print(dcmFileNames) cut = re.findall("\d+",dcmFileNames[2]) ds = pydicom.dcmread(dcmFileName) SOPs.append(ds.SOPInstanceUID) cuts.append(int(cut[0])) cuts = np.array(cuts) #print(np.sort(cuts)) #cuts_index = cuts.argsort() SOPs = np.array(SOPs) SOPs = SOPs[np.argsort(cuts)] SOPs = SOPs.tolist() #print(SOPs) return SOPs按行解释一下这段代码
这段代码定义了一个名为 `findSOPs` 的函数,函数的输入参数为 `path`,表示一个文件夹的路径。函数的作用是在指定文件夹中查找所有的DICOM格式的文件,并返回这些文件的SOPInstanceUID(唯一标识符)。
代码的第一行使用 `os.listdir` 函数获取指定路径下的所有文件名,并将它们保存在 `dcmFileNames` 列表中。
接下来,代码定义了两个空列表 `cuts` 和 `SOPs`,用于保存文件名中的数值和每个文件的 SOPInstanceUID。
代码通过遍历 `dcmFileNames` 列表,判断当前文件名是否包含字符串 "CT.",如果包含,则将该文件的路径保存在 `dcmFileName` 变量中。
接着,代码使用 `re.findall` 函数从 `dcmFileNames` 中提取出文件名中的数字。然后,代码使用 `pydicom.dcmread` 函数读取 DICOM 文件,获取其中的 SOPInstanceUID,并将其添加到 `SOPs` 列表中。同时,将文件名中提取出的数字添加到 `cuts` 列表中。
代码使用 `numpy` 库将 `cuts` 转换成一个数组,并使用 `argsort` 函数对数组进行排序,返回的是每个元素在排序后的数组中的下标。
接下来,代码使用 `SOPs` 数组的下标进行切片操作,得到按照 `cuts` 数组排序后的 `SOPs` 数组。最后将 `SOPs` 转换成列表,并返回该列表作为函数的输出结果。
总体来说,该函数的作用是根据 DICOM 文件名中的数字信息,将 DICOM 文件按照数字顺序进行排序,并返回每个文件的 SOPInstanceUID。
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