tarfile.open('CUB_200_2011.tar', 'r:gz')
时间: 2023-08-21 22:07:50 浏览: 165
如果你使用 `tarfile.open('CUB_200_2011.tar', 'r:gz')` 打开一个名为 `CUB_200_2011.tar` 的文件,那么在解压缩时会出现错误,因为该文件不是一个正确的 `gzip` 格式的压缩文件。
`tarfile` 模块中的 `open()` 方法支持多种压缩格式,包括 `gzip`、`bzip2`、`xz` 和 `tar` 等格式。但是,要正确地打开和解压缩一个文件,你需要指定正确的压缩格式。
在这个例子中,如果你要打开一个 `gzip` 格式的压缩文件 `CUB_200_2011.tar.gz`,你应该使用 `r:gz` 模式打开它:
```python
import tarfile
# 打开 tar.gz 文件
with tarfile.open('CUB_200_2011.tar.gz', 'r:gz') as tar:
# 解压所有文件到当前目录
tar.extractall()
```
如果你要打开一个 `tar` 格式的文件,你应该使用 `r:` 模式打开它:
```python
import tarfile
# 打开 tar 文件
with tarfile.open('CUB_200_2011.tar', 'r:') as tar:
# 解压所有文件到当前目录
tar.extractall()
```
注意,在解压缩时,你需要使用正确的模式打开文件,以便 `tarfile` 模块可以正确地识别压缩格式并解压缩文件。
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注释以下代码”import os import tarfile from torchvision.datasets import ImageFolder from torchvision.datasets.utils import download_url, check_integrity __all__ = ['CUB2011Metric'] class CUB2011(ImageFolder): image_folder = 'CUB_200_2011/images' base_folder = 'CUB_200_2011/' url = 'http://www.vision.caltech.edu/visipedia-data/CUB-200-2011/CUB_200_2011.tgz' filename = 'CUB_200_2011.tgz' tgz_md5 = '97eceeb196236b17998738112f37df78' checklist = [ ['001.Black_footed_Albatross/Black_Footed_Albatross_0001_796111.jpg', '4c84da568f89519f84640c54b7fba7c2'], ['002.Laysan_Albatross/Laysan_Albatross_0001_545.jpg', 'e7db63424d0e384dba02aacaf298cdc0'], ['198.Rock_Wren/Rock_Wren_0001_189289.jpg', '487d082f1fbd58faa7b08aa5ede3cc00'], ['200.Common_Yellowthroat/Common_Yellowthroat_0003_190521.jpg', '96fd60ce4b4805e64368efc32bf5c6fe'] ]
这段代码定义了一个名为`CUB2011Metric`的类,它继承自`ImageFolder`类。这个类用于加载CUB-200-2011数据集,并提供了一些用于检查数据集完整性的方法。
首先,导入了一些必要的库和模块:`os`用于处理文件和路径,`tarfile`用于解压缩压缩文件,`ImageFolder`用于创建图像文件夹数据集,`download_url`和`check_integrity`用于下载和检查文件完整性。
在类的定义中,指定了一些静态变量:
- `image_folder`:图像文件夹的路径。
- `base_folder`:基础文件夹的路径。
- `url`:数据集的下载链接。
- `filename`:下载的压缩文件名。
- `tgz_md5`:压缩文件的MD5校验和。
还定义了一个检查列表`checklist`,其中包含了一些图像文件相对路径和对应的MD5校验和。这些信息将用于检查下载的数据集文件是否完整。
类继承了`ImageFolder`类,并没有定义额外的方法或重写父类的方法。因此,这个类的主要作用是加载CUB-200-2011数据集,并提供了一些用于检查数据集完整性的方法。
将这两个代码结合import cv2 import numpy as np import urllib.request import tensorflow as tf # 下载DeepLabv3+模型权重文件 model_url = "http://download.tensorflow.org/models/deeplabv3_mnv2_pascal_train_aug_2018_01_29.tar.gz" tar_filename = "deeplabv3_mnv2_pascal_train_aug.tar.gz" urllib.request.urlretrieve(model_url, tar_filename) # 解压缩 with tarfile.open(tar_filename, "r:gz") as tar: tar.extractall() model_filename = "deeplabv3_mnv2_pascal_train_aug/frozen_inference_graph.pb" # 加载模型 graph = tf.Graph() with graph.as_default(): od_graph_def = tf.GraphDef() with tf.io.gfile.GFile(model_filename, 'rb') as fid: serialized_graph = fid.read() od_graph_def.ParseFromString(serialized_graph) tf.import_graph_def(od_graph_def, name='') # 读取图像 image_path = "your_image.jpg" image = cv2.imread(image_path) # 进行图像分割 with tf.compat.v1.Session(graph=graph) as sess: input_tensor = graph.get_tensor_by_name('ImageTensor:0') output_tensor = graph.get_tensor_by_name('SemanticPredictions:0') output = sess.run(output_tensor, feed_dict={input_tensor: image}) # 解码并可视化分割结果 segmentation_mask = np.squeeze(output) segmentation_mask = np.uint8(segmentation_mask) segmentation_mask = cv2.resize(segmentation_mask, (image.shape[1], image.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_NEAREST) # 显示原始图像和分割结果 cv2.imshow("Image", image) cv2.imshow("Segmentation Mask", segmentation_mask) cv2.waitKey(0) cv2.destroyAllWindows() model1 = models.CellposeModel(gpu=True, model_type='livecell') model2 = models.Cellpose(gpu=True,model_type='nuclei') model3= models.Cellpose(gpu=True,model_type='cyto2') 集成DeepLabv3+模型和cellpose模型
要将DeepLabv3+模型和Cellpose模型集成,你可以按照以下步骤进行修改:
```python
import cv2
import numpy as np
import urllib.request
import tensorflow as tf
from cellpose import models
# 下载DeepLabv3+模型权重文件
model_url = "http://download.tensorflow.org/models/deeplabv3_mnv2_pascal_train_aug_2018_01_29.tar.gz"
tar_filename = "deeplabv3_mnv2_pascal_train_aug.tar.gz"
urllib.request.urlretrieve(model_url, tar_filename)
# 解压缩
with tarfile.open(tar_filename, "r:gz") as tar:
tar.extractall()
model_filename = "deeplabv3_mnv2_pascal_train_aug/frozen_inference_graph.pb"
# 加载DeepLabv3+模型
graph = tf.Graph()
with graph.as_default():
od_graph_def = tf.GraphDef()
with tf.io.gfile.GFile(model_filename, 'rb') as fid:
serialized_graph = fid.read()
od_graph_def.ParseFromString(serialized_graph)
tf.import_graph_def(od_graph_def, name='')
# 加载Cellpose模型
model1 = models.CellposeModel(gpu=True, model_type='livecell')
model2 = models.CellposeModel(gpu=True, model_type='nuclei')
model3 = models.CellposeModel(gpu=True, model_type='cyto2')
# 读取图像
image_path = "your_image.jpg"
image = cv2.imread(image_path)
# 进行图像分割(DeepLabv3+模型)
with tf.compat.v1.Session(graph=graph) as sess:
input_tensor = graph.get_tensor_by_name('ImageTensor:0')
output_tensor = graph.get_tensor_by_name('SemanticPredictions:0')
output = sess.run(output_tensor, feed_dict={input_tensor: image})
# 解码并可视化分割结果(DeepLabv3+模型)
segmentation_mask = np.squeeze(output)
segmentation_mask = np.uint8(segmentation_mask)
segmentation_mask = cv2.resize(segmentation_mask, (image.shape[1], image.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_NEAREST)
# 进行图像分割(Cellpose模型)
masks1, _, _, _ = model1.eval(image)
masks2, _, _, _ = model2.eval(image)
masks3, _, _, _ = model3.eval(image)
# 可视化结果
cv2.imshow("Original Image", image)
cv2.imshow("Segmentation Mask (DeepLabv3+)", segmentation_mask)
cv2.imshow("Cell Masks (Model 1)", masks1)
cv2.imshow("Cell Masks (Model 2)", masks2)
cv2.imshow("Cell Masks (Model 3)", masks3)
cv2.waitKey(0)
cv2.destroyAllWindows()
```
这样,你就可以同时使用DeepLabv3+模型和Cellpose模型进行图像分割和细胞分割了。请注意,你需要根据你的需求进行适当的调整和修改。
希望这可以帮助到你!如果还有其他问题,请随时告诉我。
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