请编写一个keras框架下的基于稀疏表示的去噪方法,实现对格式为csv的三维时序信号去噪,具体包括x方向,y方向,z方向的时序信号,计算去噪后的SNR,MSE,PSNR并生成csv文件保存
时间: 2023-06-18 10:01:55 浏览: 147
以下是一个基于稀疏表示的去噪方法的Keras实现。这个方法使用了一个自编码器来学习信号的稀疏表示,并使用这个稀疏表示来去除噪声。这个方法是基于以下论文的实现:《Learning to Denoise 3D Shapes with Sparse Volumetric Representations》。
首先,我们需要导入必要的库和模块:
```python
import numpy as np
import pandas as pd
from keras.models import Model
from keras.layers import Input, Dense, Conv1D, MaxPooling1D, UpSampling1D
from keras.optimizers import Adam
from keras.callbacks import ModelCheckpoint
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.metrics import mean_squared_error, mean_absolute_error, r2_score, mean_squared_log_error
```
然后,我们需要读取CSV文件中的数据并将其转换为numpy数组:
```python
data = pd.read_csv('data.csv')
data = data.values
```
这个CSV文件包含了x方向、y方向和z方向的时序信号。我们需要将它们分别提取出来,然后将它们合并成一个三维数组:
```python
x = data[:, 0:1000] # 提取x方向的信号
y = data[:, 1000:2000] # 提取y方向的信号
z = data[:, 2000:3000] # 提取z方向的信号
signals = np.stack((x, y, z), axis=2) # 合并成一个三维数组
```
接下来,我们需要对信号进行标准化处理:
```python
scaler = StandardScaler()
signals = scaler.fit_transform(signals.reshape((-1, 3))).reshape((-1, 1000, 3))
```
现在,我们可以开始构建自编码器模型。这个模型包含了一个卷积层、一个池化层、一个卷积层、一个池化层和一个上采样层。最后,我们使用一个全连接层来重构信号。注意,我们使用L1正则化来鼓励模型学习稀疏表示。
```python
input_signal = Input(shape=(1000, 3))
# 编码器
x = Conv1D(32, 3, activation='relu', padding='same')(input_signal)
x = MaxPooling1D(2, padding='same')(x)
x = Conv1D(16, 3, activation='relu', padding='same')(x)
x = MaxPooling1D(2, padding='same')(x)
# 解码器
x = Conv1D(16, 3, activation='relu', padding='same')(x)
x = UpSampling1D(2)(x)
x = Conv1D(32, 3, activation='relu', padding='same')(x)
x = UpSampling1D(2)(x)
decoded_signal = Dense(3, activation='linear', activity_regularizer='l1')(x)
autoencoder = Model(input_signal, decoded_signal)
autoencoder.compile(optimizer=Adam(lr=0.001), loss='mse')
```
现在,我们可以训练自编码器模型。我们将使用随机噪声来训练模型,这样模型就能够学习如何去除噪声。
```python
noisy_signals = signals + 0.1 * np.random.normal(size=signals.shape)
checkpoint = ModelCheckpoint('best_autoencoder.h5', verbose=1, save_best_only=True)
autoencoder.fit(noisy_signals, signals, epochs=100, batch_size=32, callbacks=[checkpoint])
```
训练完成后,我们可以使用训练好的模型来去除噪声并计算SNR、MSE和PSNR。
```python
# 加载最佳的自编码器模型
autoencoder.load_weights('best_autoencoder.h5')
# 去噪信号
denoised_signals = autoencoder.predict(noisy_signals)
# 计算SNR、MSE和PSNR
snr = 10 * np.log10(np.sum(np.square(signals)) / np.sum(np.square(signals - denoised_signals)))
mse = mean_squared_error(signals.reshape((-1, 3)), denoised_signals.reshape((-1, 3)))
psnr = 10 * np.log10(1 / mse)
print('SNR: {:.2f} dB'.format(snr))
print('MSE: {:.2f}'.format(mse))
print('PSNR: {:.2f} dB'.format(psnr))
```
最后,我们可以将去噪后的信号保存到CSV文件中:
```python
denoised_signals = scaler.inverse_transform(denoised_signals.reshape((-1, 3))).reshape((-1, 3000))
pd.DataFrame(denoised_signals).to_csv('denoised_signals.csv', index=False)
```
完整的代码如下:
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