有train_files、val_files和test_files三个数据集,都是由{"img","lable"}组成的列表,现在需要用monai库中的一些转换函数,包括loadimage、ensurechannelfirst,resize、copyitem和randrotate来处理这些图像,其中copyitems只针对label=1的图像复制6倍,copyitens内参数只有keys, times,name以及allow_missing_key,然后对三个数据集做CacheDataset(),其中data参数为train_files,val_files和test_files,transform为定义好的transforme,代码如何实现
时间: 2024-02-29 07:51:49 浏览: 129
好的,我来解答这个问题。
首先,需要导入monai库和其他需要的模块:
```python
import monai
from monai.transforms import (
LoadImage,
EnsureChannelFirst,
Resize,
RandRotate,
CopyItems,
)
from monai.data import CacheDataset
```
然后,定义一个名为“transforms”的列表,包含需要应用的转换函数:
```python
transforms = [
LoadImage(image_only=True), # 仅加载图像,不加载标签
EnsureChannelFirst(), # 将通道维移动到第一个维度
Resize((256, 256, 256)), # 调整图像大小为256x256x256
RandRotate(range_x=15, range_y=15, range_z=15, prob=0.5), # 随机旋转
CopyItems(keys=["img"], times=6, name="img", allow_missing_keys=True, filter_fn=lambda x: x["label"] == 1), # 复制label为1的图像
]
```
接着,定义一个名为“datasets”的字典,包含三个数据集的路径和标签:
```python
train_files = [{"img": "/path/to/train/img1.nii.gz", "label": 0},
{"img": "/path/to/train/img2.nii.gz", "label": 1},
{"img": "/path/to/train/img3.nii.gz", "label": 0},
{"img": "/path/to/train/img4.nii.gz", "label": 1}]
val_files = [{"img": "/path/to/val/img1.nii.gz", "label": 0},
{"img": "/path/to/val/img2.nii.gz", "label": 1},
{"img": "/path/to/val/img3.nii.gz", "label": 0},
{"img": "/path/to/val/img4.nii.gz", "label": 1}]
test_files = [{"img": "/path/to/test/img1.nii.gz", "label": 0},
{"img": "/path/to/test/img2.nii.gz", "label": 1},
{"img": "/path/to/test/img3.nii.gz", "label": 0},
{"img": "/path/to/test/img4.nii.gz", "label": 1}]
datasets = {"train": train_files, "val": val_files, "test": test_files}
```
最后,使用“CacheDataset”类创建缓存数据集:
```python
cached_datasets = {split: CacheDataset(data=datasets[split], transform=transforms) for split in datasets.keys()}
```
这样就完成了数据集的处理和缓存,可以用这些数据集来训练和测试模型。
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