AgglomerativeClustering画层次聚类树状图
时间: 2023-10-24 07:06:21 浏览: 300
要画出 Agglomerative Clustering 的层次聚类树状图,需要使用 Python 中的 `scipy` 库。以下是一个简单的例子:
```python
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
import matplotlib.pyplot as plt
# 生成一些随机数据
X = [[1, 2], [1, 4], [1, 0], [4, 2], [4, 4], [4, 0]]
# 计算链接矩阵
Z = linkage(X, 'ward')
# 画出层次聚类树状图
fig = plt.figure(figsize=(5, 3), dpi=150)
dn = dendrogram(Z)
plt.show()
```
在这个例子中,我们使用 `linkage` 函数计算链接矩阵,然后使用 `dendrogram` 函数画出层次聚类树状图。`ward` 表示使用 ward 方法进行聚类。你可以根据自己的需求选择其他的聚类方法。
相关问题
python 如何设置层次聚类树状图的类别数目
要设置层次聚类树状图的类别数目,需要使用聚类算法的参数来控制。常见的聚类算法包括k-means聚类、层次聚类等。
对于层次聚类,可以使用距离阈值的方法来控制类别数目。具体来说,可以设置一个距离阈值,将距离小于该阈值的样本合并为一个类别,直到类别数目满足要求为止。
在Python中,可以使用scikit-learn库中的AgglomerativeClustering类来进行层次聚类。该类的参数中有一个n_clusters参数,可以用来设置类别数目。具体代码如下:
```python
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
# 构造数据
X = [[1, 2], [1, 4], [1, 0],
[4, 2], [4, 4], [4, 0]]
# 创建聚类模型
clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=2)
# 训练模型并预测结果
labels = clustering.fit_predict(X)
print(labels)
```
在上述代码中,n_clusters参数被设置为2,表示希望将数据分为2个类别。运行结果为[0 0 0 1 1 1],表示第1、2、3个样本属于第0类,第4、5、6个样本属于第1类。
python聚类树状图
要绘制Python中的聚类树状图,您可以使用scikit-learn和matplotlib库来完成。下面是一个简单的示例代码:
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import make_blobs
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram
# 创建一个示例数据集
X, y = make_blobs(n_samples=100, centers=3, random_state=0)
# 使用层次聚类算法进行聚类
clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=None, distance_threshold=0)
clustering.fit(X)
# 绘制树状图
dendrogram(clustering.linkage_, labels=np.arange(len(X)))
plt.xlabel('样本索引')
plt.ylabel('距离')
plt.title('聚类树状图')
plt.show()
```
在上面的代码中,首先使用`make_blobs`函数创建了一个随机的示例数据集。然后,使用`AgglomerativeClustering`进行层次聚类,其中`n_clusters=None`表示不确定聚类数量。接下来,通过调用`dendrogram`函数并传入层次聚类结果的连接矩阵,绘制了树状图。最后,使用matplotlib库对图像进行标注和展示。
请注意,这只是一个简单的示例,您可以根据您的数据和需求进行相应的修改和调整。
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