AgglomerativeClustering画层次聚类树状图

时间: 2023-10-24 11:06:21 浏览: 47
要画出 Agglomerative Clustering 的层次聚类树状图,需要使用 Python 中的 `scipy` 库。以下是一个简单的例子: ```python from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage import matplotlib.pyplot as plt # 生成一些随机数据 X = [[1, 2], [1, 4], [1, 0], [4, 2], [4, 4], [4, 0]] # 计算链接矩阵 Z = linkage(X, 'ward') # 画出层次聚类树状图 fig = plt.figure(figsize=(5, 3), dpi=150) dn = dendrogram(Z) plt.show() ``` 在这个例子中,我们使用 `linkage` 函数计算链接矩阵,然后使用 `dendrogram` 函数画出层次聚类树状图。`ward` 表示使用 ward 方法进行聚类。你可以根据自己的需求选择其他的聚类方法。
相关问题

python 如何设置层次聚类树状图的类别数目

要设置层次聚类树状图的类别数目,需要使用聚类算法的参数来控制。常见的聚类算法包括k-means聚类、层次聚类等。 对于层次聚类,可以使用距离阈值的方法来控制类别数目。具体来说,可以设置一个距离阈值,将距离小于该阈值的样本合并为一个类别,直到类别数目满足要求为止。 在Python中,可以使用scikit-learn库中的AgglomerativeClustering类来进行层次聚类。该类的参数中有一个n_clusters参数,可以用来设置类别数目。具体代码如下: ```python from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering # 构造数据 X = [[1, 2], [1, 4], [1, 0], [4, 2], [4, 4], [4, 0]] # 创建聚类模型 clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=2) # 训练模型并预测结果 labels = clustering.fit_predict(X) print(labels) ``` 在上述代码中,n_clusters参数被设置为2,表示希望将数据分为2个类别。运行结果为[0 0 0 1 1 1],表示第1、2、3个样本属于第0类,第4、5、6个样本属于第1类。

python聚类树状图

要绘制Python中的聚类树状图,您可以使用scikit-learn和matplotlib库来完成。下面是一个简单的示例代码: ```python import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.datasets import make_blobs from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram # 创建一个示例数据集 X, y = make_blobs(n_samples=100, centers=3, random_state=0) # 使用层次聚类算法进行聚类 clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=None, distance_threshold=0) clustering.fit(X) # 绘制树状图 dendrogram(clustering.linkage_, labels=np.arange(len(X))) plt.xlabel('样本索引') plt.ylabel('距离') plt.title('聚类树状图') plt.show() ``` 在上面的代码中,首先使用`make_blobs`函数创建了一个随机的示例数据集。然后,使用`AgglomerativeClustering`进行层次聚类,其中`n_clusters=None`表示不确定聚类数量。接下来,通过调用`dendrogram`函数并传入层次聚类结果的连接矩阵,绘制了树状图。最后,使用matplotlib库对图像进行标注和展示。 请注意,这只是一个简单的示例,您可以根据您的数据和需求进行相应的修改和调整。

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