diffpy-cmi实现pdf

diffpy-cmi可以用于计算材料的Pair Distribution Function（PDF），它是材料中原子间距离分布的一种函数。PDF是一项重要的实验技术，可以用来研究材料的结构和动力学性质。diffpy-cmi提供了一个名为PDFCalculator的类，可以计算材料的PDF。具体来说，它使用原子坐标和结构因子来计算PDF，然后通过傅里叶变换将其转换为实空间中的函数。PDFCalculator类的使用方法如下：

from diffpy.structure import loadStructure
from diffpy.srfit.pdf import PDFCalculator

# Load a structure file
structure = loadStructure('filename.xyz')

# Create a PDF calculator
calculator = PDFCalculator()
calculator.setStructures([structure])
calculator.qmax = 20.0

# Calculate the PDF
r, g = calculator.evaluate()

# Plot the PDF
import matplotlib.pyplot as plt
plt.plot(r, g)
plt.show()

在上面的示例中，我们首先使用`loadStructure`函数加载一个结构文件，然后创建一个PDFCalculator对象，并将其与结构文件关联。我们还设置了一个`qmax`参数，它指定了计算PDF的最大$q$值。最后，我们使用`evaluate`方法计算PDF，并将其绘制出来。