diffpy-cmi进行pdf分析

DiffPy-CMI库中的PDF分析是其中一个非常有用的功能。PDF（Pair Distribution Function，即对分布函数）是用于描述材料中原子之间距离分布的一种方法。DiffPy-CMI库可以用于计算材料的PDF，从而得到材料中原子之间的距离分布。下面是一个简单的例子：

1.安装DiffPy-CMI

pip install diffpy-cmi

2.导入DiffPy-CMI

from diffpy.structure import Structure
from diffpy.srfit.pdf import PDFContribution
from diffpy.srfit.fitbase import FitRecipe, FitResults

3.读入结构文件

structure = Structure()
structure.read('structure.cif')

4.创建PDFContribution对象

pdf = PDFContribution('pdf')
pdf.setStructure(structure)
pdf.qmax = 20.0

5.创建FitRecipe对象

recipe = FitRecipe()
recipe.addContribution(pdf)
recipe.addVar(pdf.scale, 1.0)
recipe.addVar(pdf.delta2, 0.1)
recipe.addVar(pdf.eta, 0.05)

6.计算PDF

r = pdf.getProfile().r
g = pdf.getProfile().g

7.拟合PDF

results = recipe.run()

8.获取拟合结果

print(results)

这个例子演示了如何使用DiffPy-CMI计算并拟合材料的PDF。通过调整PDFContribution对象的参数，我们可以获得更准确的PDF，从而更好地理解材料的结构。