emd python代码

以下是Python中使用emd库计算EMD（Earth Mover's Distance）的示例代码：

from pyemd import emd
import numpy as np

# 定义两个分布
P = np.array([0.2, 0.3, 0.5])
Q = np.array([0.1, 0.6, 0.3])

# 定义两个距离矩阵
C = np.array([[0, 1, 2], [1, 0, 1], [2, 1, 0]])
D = np.array([[5, 2, 1], [2, 4, 2], [1, 2, 5]])

# 计算EMD
emd_dist = emd(P, Q, C)
emd_dist_with_flow = emd(P, Q, C, D)

print("EMD distance: ", emd_dist)
print("EMD distance with flow: ", emd_dist_with_flow)

在上面的代码中，我们首先使用numpy数组定义了两个分布P和Q，然后使用numpy数组定义了两个距离矩阵C和D。最后，我们使用emd函数计算了两个分布之间的EMD距离，并将结果打印出来。如果您想计算EMD距离和流，则可以传递距离矩阵D作为第四个参数。

相关问题

EMD降噪python代码

以下是一个简单的EMD降噪Python代码示例：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from PyEMD import EMD

# 生成信号
t = np.linspace(0, 1, 1000)
x = np.sin(2*np.pi*5*t) + 0.2*np.sin(2*np.pi*20*t)

# EMD降噪
emd = EMD()
IMFs = emd(x)
residual = IMFs[-1]
clean_signal = x - residual

# 绘制结果
plt.subplot(2, 1, 1)
plt.plot(t, x)
plt.title('Original Signal')
plt.subplot(2, 1, 2)
plt.plot(t, clean_signal)
plt.title('Clean Signal')
plt.tight_layout()
plt.show()

这个代码示例使用PyEMD库中的EMD类来实现EMD降噪。首先，我们生成一个包含5Hz和20Hz正弦波的信号。然后，我们使用EMD类将信号分解为一组内在模态函数（IMFs）。最后，我们从IMFs中获取残差，并将其从原始信号中减去以获得降噪信号。

请注意，这只是一个简单的示例，可能需要进行更多的调整和优化，以适用于更复杂的信号和降噪任务。

EMD分解python代码

EMD（Earth Mover's Distance）是一种衡量两个概率分布相似度的方法。其核心思想是将一个分布通过一系列步骤转化为另一个分布，每个步骤都有一个成本，最终计算所有步骤的成本之和作为两个分布的距离。

下面是使用Python实现EMD分解的代码：

import numpy as np

def emd(distribution1, distribution2, cost_matrix):
    # 计算两个分布的累积分布函数
    cdf1 = np.cumsum(distribution1)
    cdf2 = np.cumsum(distribution2)
    
    # 初始化一个全零的流量矩阵
    flow = np.zeros(cost_matrix.shape)
    
    # 当前分布的累积质量和
    mass1 = 0
    mass2 = 0
    
    # 遍历所有的成本矩阵元素
    for i in range(cost_matrix.shape[0]):
        for j in range(cost_matrix.shape[1]):
            # 如果已经有流量了，跳过
            if flow[i,j] > 0:
                continue
            
            # 计算从i到j的最小成本路径
            path_cost, path = find_path(cost_matrix, flow, cdf1, cdf2, i, j)
            
            # 计算沿该路径的最大可用流量
            max_flow = min(distribution1[path[0]] - mass1, distribution2[path[-1]] - mass2)
            
            # 在路径上增加流量
            for k in range(len(path)-1):
                flow[path[k], path[k+1]] += max_flow
            
            # 更新累积质量和
            mass1 += max_flow
            mass2 += max_flow
            
            # 如果已经匹配完毕，跳出循环
            if mass1 == np.sum(distribution1) and mass2 == np.sum(distribution2):
                break
    
    # 计算总成本
    total_cost = np.sum(flow * cost_matrix)
    
    return total_cost, flow

def find_path(cost_matrix, flow, cdf1, cdf2, i, j):
    # 计算从i到j的路径成本
    path_cost = cost_matrix[i,j] + cdf1[i] - cdf1[j] - cdf2[j] + cdf2[i]
    
    # 如果路径成本为0，说明已经达到最优解
    if path_cost == 0:
        return 0, [i, j]
    
    # 初始化一个队列，用于广度优先搜索
    queue = [(i, j)]
    
    # 初始化一组空间，用于记录路径
    path_set = {(i, j): []}
    
    # 开始广度优先搜索
    while len(queue) > 0:
        # 弹出队列中的第一个元素
        curr = queue.pop(0)
        
        # 遍历所有可能的下一步
        for next_node in get_next_nodes(curr, cost_matrix.shape[0], cost_matrix.shape[1]):
            # 如果没有增广路，跳过
            if flow[next_node] >= 1:
                continue
            
            # 计算到下一个节点的路径成本
            next_cost = cost_matrix[curr] + cdf1[curr[0]] - cdf1[next_node[0]] - cdf2[next_node[1]] + cdf2[curr[1]]
            
            # 如果路径成本相等，将节点加入队列中
            if next_cost == path_cost:
                queue.append(next_node)
                path_set[next_node] = path_set[curr] + [next_node]
    
    # 返回最小成本路径及其成本
    return path_cost, path_set[(i, j)]

def get_next_nodes(node, n_rows, n_cols):
    # 计算下一个节点可能的坐标
    next_nodes = []
    if node[0] < n_rows - 1:
        next_nodes.append((node[0]+1, node[1]))
    if node[0] > 0:
        next_nodes.append((node[0]-1, node[1]))
    if node[1] < n_cols - 1:
        next_nodes.append((node[0], node[1]+1))
    if node[1] > 0:
        next_nodes.append((node[0], node[1]-1))
    return next_nodes

该代码实现了EMD分解算法的核心逻辑。其中，emd函数接受两个分布和一个成本矩阵作为输入，计算两个分布之间的EMD距离和最优的流量矩阵。主要步骤包括计算累积分布函数、初始化流量矩阵、遍历成本矩阵、查找最小成本路径、更新流量矩阵、计算总成本等。find_path函数实现了广度优先搜索查找最小成本路径的逻辑，get_next_nodes函数计算一个节点可能的下一步坐标。