现在我有一个稀疏矩阵,里面的值是药物相互作用的分数,怎么画出它的分布图

时间: 2024-02-24 16:59:07 浏览: 25
您可以使用 `matplotlib` 库中的 `imshow()` 方法来画出稀疏矩阵的分布图。不过,由于稀疏矩阵中大部分元素都是 0,因此需要对数据进行预处理。以下是一个简单的代码示例: ```python import numpy as np from scipy.sparse import csr_matrix import matplotlib.pyplot as plt # 创建一个稀疏矩阵 data = np.array([1, 2, 3, 4, 5, 6]) row_indices = np.array([0, 0, 1, 1, 2, 2]) col_indices = np.array([0, 1, 0, 1, 0, 1]) sparse_matrix = csr_matrix((data, (row_indices, col_indices)), shape=(3, 2)) # 将稀疏矩阵转换为密集矩阵,并将0值替换为NaN dense_matrix = sparse_matrix.toarray() dense_matrix[dense_matrix == 0] = np.nan # 画出分布图 plt.imshow(dense_matrix, cmap='viridis') plt.colorbar() plt.show() ``` 在这个示例中,我们首先将稀疏矩阵转换为密集矩阵,并将其中的 0 值替换为 NaN。然后,我们使用 `imshow()` 方法将密集矩阵画出来,使用 `cmap` 参数设置颜色映射,使用 `colorbar()` 方法添加颜色条。最后,使用 `show()` 方法显示图像。

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