利用SHAP进行致因分析并绘图
时间: 2023-07-11 21:13:00 浏览: 139
SHAP (SHapley Additive exPlanations) 是一个用于解释黑盒模型的框架,它可以为每个特征的贡献程度进行排名,并给出每个预测的解释。在进行致因分析时,我们可以使用 SHAP 来确定每个特征对于预测结果的贡献程度,从而识别出哪些特征是影响预测结果的主要因素。
下面是一个使用 SHAP 进行致因分析并绘图的 Python 示例代码:
```python
import shap
import numpy as np
import pandas as pd
from xgboost import XGBClassifier
from sklearn.datasets import load_breast_cancer
from sklearn.model_selection import train_test_split
# 加载数据集
data = load_breast_cancer()
X = pd.DataFrame(data.data, columns=data.feature_names)
y = data.target
# 划分训练集和测试集
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2, random_state=42)
# 训练模型
xgb = XGBClassifier(random_state=42)
xgb.fit(X_train, y_train)
# 初始化 SHAP
explainer = shap.TreeExplainer(xgb)
shap_values = explainer.shap_values(X_test)
# 绘制 SHAP 柱状图
shap.summary_plot(shap_values, X_test, plot_type="bar")
```
首先,我们加载了乳腺癌数据集,并使用 XGBClassifier 训练了一个分类模型。接着,我们使用 SHAP 的 TreeExplainer 对模型进行解释,并计算出每个特征对于每个测试样本的 SHAP 值。最后,我们使用 shap.summary_plot 函数生成 SHAP 柱状图,该图显示了每个特征的重要性排序。
除了 SHAP 柱状图之外,SHAP 还提供了许多其他有用的可视化工具,如 SHAP 散点图、SHAP 组合图等,这些工具能够更直观地展示每个特征对预测结果的影响。
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