python实现层次聚类
时间: 2023-07-07 08:25:46 浏览: 115
好的,以下是Python实现层次聚类的示例代码:
```python
import numpy as np
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
import matplotlib.pyplot as plt
# 生成样本数据
X = np.array([[5,3], [10,15], [15,12], [24,10], [30,30], [85,70], [71,80], [60,78], [70,55], [80,91]])
# 使用ward方法进行层次聚类
Z = linkage(X, 'ward')
# 将层次聚类结果以树状图的形式展示
fig = plt.figure(figsize=(25, 10))
dn = dendrogram(Z)
plt.show()
```
在这个示例中,我们使用了`numpy`和`scipy`库来生成样本数据和进行层次聚类。其中,`linkage`函数是进行层次聚类的核心函数,它可以根据不同的距离度量方法(如欧几里得距离、曼哈顿距离等)和聚类算法(如最小距离、最大距离、平均距离等)来对样本进行聚类。而`dendrogram`函数则是将聚类结果以树状图的形式展示出来。
以上是一个简单的层次聚类的实现示例,你可以根据自己的需求来选择不同的距离度量方法和聚类算法,并对聚类结果进行可视化展示。
相关问题
用python实现层次聚类
层次聚类是一种无监督学习的聚类方法,其基本思想是将样本逐渐合并成越来越大的类群,直到所有样本都被合并为止。常见的层次聚类方法有凝聚层次聚类和分裂层次聚类,其中凝聚层次聚类是将每个样本视为一个初始类,然后逐步将相似度最高的类合并成更大的类群,最终形成一个完整的聚类树。
下面是一个基于Python的凝聚层次聚类实现,使用的是scikit-learn库中的AgglomerativeClustering类:
```python
import numpy as np
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
from sklearn.datasets import make_blobs
import matplotlib.pyplot as plt
# 生成随机数据集
X, y = make_blobs(n_samples=50, centers=3, random_state=42)
# 构建模型
model = AgglomerativeClustering(n_clusters=3)
# 拟合模型
y_pred = model.fit_predict(X)
# 可视化结果
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=y_pred)
plt.title("Agglomerative Clustering")
plt.show()
```
上述代码中,我们首先生成一个随机数据集,然后使用AgglomerativeClustering类构建层次聚类模型,设置聚类数目为3,最后拟合模型并可视化聚类结果。
请用Python实现层次聚类,并绘制谱系图
好的,我可以为您提供一个用Python实现层次聚类的示例代码,并使用matplotlib库绘制谱系图。请先安装scipy和matplotlib库:
```
pip install scipy
pip install matplotlib
```
接下来是示例代码:
```python
import scipy.cluster.hierarchy as shc
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# 生成随机数据
X = np.random.rand(10, 2)
# 计算距离矩阵
distance_matrix = shc.distance.pdist(X)
# 计算层次聚类结果
linkage = shc.linkage(distance_matrix, method='ward')
# 绘制谱系图
plt.figure(figsize=(10, 7))
plt.title("Dendrogram")
dend = shc.dendrogram(linkage)
plt.show()
```
运行后,您将看到生成的谱系图。您可以将X替换为您的数据,以便进行层次聚类和绘制谱系图。
注意:这只是一个示例代码,您需要根据您的实际需求进行适当的修改和调整。
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