y_pred = np.argmax(y_pred_proba, axis=1)是什么意思

时间: 2024-02-26 08:52:38 浏览: 272
这行代码使用了NumPy库中的`argmax()`函数,用于沿着指定的轴返回数组中具有最大值的索引。在这里,`y_pred_proba`是一个二维数组,每一行表示一个样本在各个类别上的概率分布,因此`axis=1`表示沿着第2个轴(即行)进行操作,返回每个样本在概率分布中概率最大的类别的索引,将结果存储在`y_pred`中。 通俗地说,这行代码的作用是根据每个样本在各个类别上的概率分布,预测出每个样本最有可能属于哪个类别。
相关问题

predicted = clf.predict(X_new_tfidf) print(predicted) y_prob=clf.predict_proba(X_new_tfidf) y_pred_class = np.argmax(y_prob, axis=1) # y_pred = [1 if prob > 0.5 else 0 for prob in y_prob] y_pred = np.where(y_prob > 0.5, 1, 0)[:,0] print(y_pred) total_cnt = 0 correct_cnt = 0 for test_label, predicte in zip(test_labels, predicted): total_cnt += 1 if test_label == predicte: correct_cnt += 1 print('%r => %s' % (test_label, predicte)) # 将预测值和真实标签存储在一个数组中 y_true = np.array(test_labels) # 按照预测概率值排序 order = y_prob.argsort() # 计算每个点的两个指标 fp = np.cumsum((y_true[order] == 0) & (y_pred[order] == 1)) tp = np.cumsum((y_true[order] == 1) & (y_pred[order] == 1)) fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y_true, y_pred_class)用SciPy计算ks

在代码中已经计算了y_pred_class,因此可以直接使用y_pred_class计算KS值。 具体使用方法如下: 1. 导入需要的库: ```python from scipy.stats import ks_2samp ``` 2. 准备真实标签数据`y_true`和预测概率值数据`y_prob`。 3. 将预测概率值按照预测标签排序,并计算累计的真正例率(TPR)和假正例率(FPR): ```python order = y_prob.argsort() fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y_true[order], y_prob[:, 1][order]) ``` 其中,`y_prob[:, 1]`表示预测为正例的概率值。 4. 计算KS值: ```python ks_statistic, p_value = ks_2samp(y_pred_class, y_prob[:, 1]) ``` 其中,`y_pred_class`为预测标签,`y_prob[:, 1]`为预测为正例的概率值。 示例代码如下: ```python from scipy.stats import ks_2samp from sklearn.metrics import roc_curve import numpy as np # 准备真实标签数据和预测概率值数据 y_true = np.array(test_labels) y_prob = clf.predict_proba(X_new_tfidf) # 将预测概率值按照预测标签排序,并计算累计的真正例率和假正例率 order = y_prob.argsort() fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y_true[order], y_prob[:, 1][order]) # 计算KS值 ks_statistic, p_value = ks_2samp(y_pred_class, y_prob[:, 1]) # 输出结果 print("KS值为:", ks_statistic) print("p-value为:", p_value) ``` 注意,KS值越大,表示模型预测能力越强,模型的区分度越大。而p-value值越小,表示KS值越显著,模型的区分度越好。

dict_of_models = {'RandomForest': RandomPipeline, 'AdaBoost': AdaPipeline, 'SVM': SVMPipeline, 'KNN': KNNPipeline, 'LR': LRPipeline};def evaluation(model): # calculating the probabilities y_pred_proba = model.predict_proba(X_test) # finding the predicted valued y_pred = np.argmax(y_pred_proba,axis=1) print('Accuracy = ', accuracy_score(y_test, y_pred)) print('-') print(confusion_matrix(y_test,y_pred)) print('-') print(classification_report(y_test,y_pred)) print('-') N, train_score, test_score = learning_curve(model, X_train, y_train, cv=4, scoring='f1', train_sizes=np.linspace(0.1,1,10)) plt.figure(figsize=(5,5)) plt.plot(N, train_score.mean(axis=1), label='train score') plt.plot(N, test_score.mean(axis=1), label='validation score') plt.legend() plt.show()

这段代码定义了一个字典 dict_of_models,其中包含了几个分类模型和对应的 Pipeline 对象。然后定义了一个名为 evaluation 的函数,函数接受一个模型对象作为参数。在函数内部,首先使用传入的模型对象对测试集 X_test 进行预测,并计算预测的概率值。接着使用 np.argmax 函数找到预测值中概率最大的类别,作为最终的预测结果。然后打印出模型的准确率、混淆矩阵和分类报告。最后使用 learning_curve 函数计算训练集和验证集的 F1 分数,并绘制学习曲线。
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修改和补充下列代码得到十折交叉验证的平均每一折auc值和平均每一折aoc曲线,平均每一折分类报告以及平均每一折混淆矩阵 min_max_scaler = MinMaxScaler() X_train1, X_test1 = x[train_id], x[test_id] y_train1, y_test1 = y[train_id], y[test_id] # apply the same scaler to both sets of data X_train1 = min_max_scaler.fit_transform(X_train1) X_test1 = min_max_scaler.transform(X_test1) X_train1 = np.array(X_train1) X_test1 = np.array(X_test1) config = get_config() tree = gcForest(config) tree.fit(X_train1, y_train1) y_pred11 = tree.predict(X_test1) y_pred1.append(y_pred11 X_train.append(X_train1) X_test.append(X_test1) y_test.append(y_test1) y_train.append(y_train1) X_train_fuzzy1, X_test_fuzzy1 = X_fuzzy[train_id], X_fuzzy[test_id] y_train_fuzzy1, y_test_fuzzy1 = y_sampled[train_id], y_sampled[test_id] X_train_fuzzy1 = min_max_scaler.fit_transform(X_train_fuzzy1) X_test_fuzzy1 = min_max_scaler.transform(X_test_fuzzy1) X_train_fuzzy1 = np.array(X_train_fuzzy1) X_test_fuzzy1 = np.array(X_test_fuzzy1) config = get_config() tree = gcForest(config) tree.fit(X_train_fuzzy1, y_train_fuzzy1) y_predd = tree.predict(X_test_fuzzy1) y_pred.append(y_predd) X_test_fuzzy.append(X_test_fuzzy1) y_test_fuzzy.append(y_test_fuzzy1)y_pred = to_categorical(np.concatenate(y_pred), num_classes=3) y_pred1 = to_categorical(np.concatenate(y_pred1), num_classes=3) y_test = to_categorical(np.concatenate(y_test), num_classes=3) y_test_fuzzy = to_categorical(np.concatenate(y_test_fuzzy), num_classes=3) print(y_pred.shape) print(y_pred1.shape) print(y_test.shape) print(y_test_fuzzy.shape) # 深度森林 report1 = classification_report(y_test, y_prprint("DF",report1) report = classification_report(y_test_fuzzy, y_pred) print("DF-F",report) mse = mean_squared_error(y_test, y_pred1) rmse = math.sqrt(mse) print('深度森林RMSE:', rmse) print('深度森林Accuracy:', accuracy_score(y_test, y_pred1)) mse = mean_squared_error(y_test_fuzzy, y_pred) rmse = math.sqrt(mse) print('F深度森林RMSE:', rmse) print('F深度森林Accuracy:', accuracy_score(y_test_fuzzy, y_pred)) mse = mean_squared_error(y_test, y_pred) rmse = math.sqrt(mse)

for i in range(n_trees): # 随机采样训练集 idx = np.random.choice(X_train.shape[0], size=X_train.shape[0], replace=True) X_sampled = X_train[idx, :] y_sampled = y_train[idx] # 模糊化特征值 X_fuzzy = [] for j in range(X_sampled.shape[1]): if np.median(X_sampled[:, j])> np.mean(X_sampled[:, j]): fuzzy_vals = fuzz.trapmf(X_sampled[:, j], [np.min(X_sampled[:, j]), np.mean(X_sampled[:, j]), np.median(X_sampled[:, j]), np.max(X_sampled[:, j])]) else: fuzzy_vals = fuzz.trapmf(X_sampled[:, j], [np.min(X_sampled[:, j]), np.median(X_sampled[:, j]), np.mean(X_sampled[:, j]), np.max(X_sampled[:, j])]) X_fuzzy.append(fuzzy_vals) X_fuzzy = np.array(X_fuzzy).T # 训练决策树 tree = RandomForestClassifier(n_estimators=1, max_depth=max_depth) tree.fit(X_fuzzy, y_sampled) forest.append(tree) # 创建并编译深度神经网络 inputs = keras.Input(shape=(X_train.shape[1],)) x = keras.layers.Dense(64, activation="relu")(inputs) x = keras.layers.Dense(32, activation="relu")(x) outputs = keras.layers.Dense(1, activation="sigmoid")(x) model = keras.Model(inputs=inputs, outputs=outputs) model.compile(loss="binary_crossentropy", optimizer="adam", metrics=["accuracy"]) # 使用深度神经网络对每个决策树的输出进行加权平均 y_pred = np.zeros(y_train.shape[0]) for tree in forest: a = [] for j in range(X_train.shape[1]): if np.median(X_train[:, j]) > np.mean(X_train[:, j]): fuzzy_vals = fuzz.trapmf(X_train[:, j], [np.min(X_train[:, j]), np.mean(X_train[:, j]), np.median(X_train[:, j]), np.max(X_train[:, j])]) else: fuzzy_vals = fuzz.trapmf(X_train[:, j], [np.min(X_train[:, j]), np.median(X_train[:, j]), np.mean(X_train[:, j]), np.max(X_train[:, j])]) a.append(fuzzy_vals) fuzzy_vals = np.array(a).T y_proba = tree.predict_proba(fuzzy_vals) # 将概率转换为类别标签 y_tree = np.argmax(y_proba, axis=1) y_pred += y_tree改成三分类

final_valid_predictions = {} final_test_predictions = [] scores = [] log_losses = [] balanced_log_losses = [] weights = [] for fold in range(5): train_df = df[df['fold'] != fold] valid_df = df[df['fold'] == fold] valid_ids = valid_df.Id.values.tolist() X_train, y_train = train_df.drop(['Id', 'Class', 'fold'], axis=1), train_df['Class'] X_valid, y_valid = valid_df.drop(['Id', 'Class', 'fold'], axis=1), valid_df['Class'] lgb = LGBMClassifier(boosting_type='goss', learning_rate=0.06733232950390658, n_estimators = 50000, early_stopping_round = 300, random_state=42, subsample=0.6970532011679706, colsample_bytree=0.6055755840633003, class_weight='balanced', metric='none', is_unbalance=True, max_depth=8) lgb.fit(X_train, y_train, eval_set=(X_valid, y_valid), verbose=1000, eval_metric=lgb_metric) y_pred = lgb.predict_proba(X_valid) preds_test = lgb.predict_proba(test_df.drop(['Id'], axis=1).values) final_test_predictions.append(preds_test) final_valid_predictions.update(dict(zip(valid_ids, y_pred))) logloss = log_loss(y_valid, y_pred) balanced_logloss = balanced_log_loss(y_valid, y_pred[:, 1]) log_losses.append(logloss) balanced_log_losses.append(balanced_logloss) weights.append(1/balanced_logloss) print(f"Fold: {fold}, log loss: {round(logloss, 3)}, balanced los loss: {round(balanced_logloss, 3)}") print() print("Log Loss") print(log_losses) print(np.mean(log_losses), np.std(log_losses)) print() print("Balanced Log Loss") print(balanced_log_losses) print(np.mean(balanced_log_losses), np.std(balanced_log_losses)) print() print("Weights") print(weights)

帮我为下面的代码加上注释:class SimpleDeepForest: def __init__(self, n_layers): self.n_layers = n_layers self.forest_layers = [] def fit(self, X, y): X_train = X for _ in range(self.n_layers): clf = RandomForestClassifier() clf.fit(X_train, y) self.forest_layers.append(clf) X_train = np.concatenate((X_train, clf.predict_proba(X_train)), axis=1) return self def predict(self, X): X_test = X for i in range(self.n_layers): X_test = np.concatenate((X_test, self.forest_layers[i].predict_proba(X_test)), axis=1) return self.forest_layers[-1].predict(X_test[:, :-2]) # 1. 提取序列特征(如:GC-content、序列长度等) def extract_features(fasta_file): features = [] for record in SeqIO.parse(fasta_file, "fasta"): seq = record.seq gc_content = (seq.count("G") + seq.count("C")) / len(seq) seq_len = len(seq) features.append([gc_content, seq_len]) return np.array(features) # 2. 读取相互作用数据并创建数据集 def create_dataset(rna_features, protein_features, label_file): labels = pd.read_csv(label_file, index_col=0) X = [] y = [] for i in range(labels.shape[0]): for j in range(labels.shape[1]): X.append(np.concatenate([rna_features[i], protein_features[j]])) y.append(labels.iloc[i, j]) return np.array(X), np.array(y) # 3. 调用SimpleDeepForest分类器 def optimize_deepforest(X, y): X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2) model = SimpleDeepForest(n_layers=3) model.fit(X_train, y_train) y_pred = model.predict(X_test) print(classification_report(y_test, y_pred)) # 4. 主函数 def main(): rna_fasta = "RNA.fasta" protein_fasta = "pro.fasta" label_file = "label.csv" rna_features = extract_features(rna_fasta) protein_features = extract_features(protein_fasta) X, y = create_dataset(rna_features, protein_features, label_file) optimize_deepforest(X, y) if __name__ == "__main__": main()

import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.linear_model import LogisticRegression from sklearn.metrics import confusion_matrix, accuracy_score, precision_score, recall_score, f1_score, roc_curve, roc_auc_score # 1. 数据读取与处理 data = pd.read_csv('data.csv') X = data.drop('target', axis=1) y = data['target'] X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2, random_state=42) # 2. 模型训练 model = LogisticRegression() model.fit(X_train, y_train) # 3. 模型预测 y_pred = model.predict(X_test) y_prob = model.predict_proba(X_test)[:, 1] # 4. 绘制二分类混淆矩阵 confusion_mat = confusion_matrix(y_test, y_pred) plt.imshow(confusion_mat, cmap=plt.cm.Blues) plt.title('Confusion Matrix') plt.colorbar() tick_marks = np.arange(2) plt.xticks(tick_marks, ['0', '1']) plt.yticks(tick_marks, ['0', '1']) plt.xlabel('Predicted Label') plt.ylabel('True Label') for i in range(2): for j in range(2): plt.text(j, i, confusion_mat[i, j], ha='center', va='center', color='white' if confusion_mat[i, j] > confusion_mat.max() / 2 else 'black') plt.show() # 5. 计算精确率、召回率和F1-score precision = precision_score(y_test, y_pred) recall = recall_score(y_test, y_pred) f1 = f1_score(y_test, y_pred) # 6. 计算AUC指标和绘制ROC曲线 auc = roc_auc_score(y_test, y_prob) fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y_test, y_prob) plt.plot(fpr, tpr, label='ROC curve (area = %0.2f)' % auc) plt.plot([0, 1], [0, 1], 'k--') plt.xlim([0.0, 1.0]) plt.ylim([0.0, 1.05]) plt.xlabel('False Positive Rate') plt.ylabel('True Positive Rate') plt.title('ROC Curve') plt.legend(loc="lower right") plt.show() # 7. 输出结果 print('Precision:', precision) print('Recall:', recall) print('F1-score:', f1) print('AUC:', auc)对每行代码进行注释

from sklearn import metrics from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.linear_model import LogisticRegression from imblearn.combine import SMOTETomek from sklearn.metrics import auc, roc_curve, roc_auc_score from sklearn.feature_selection import SelectFromModel import pandas as pd import numpy as np import matplotlib matplotlib.use('TkAgg') import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.metrics import confusion_matrix #1、数据输入 df_table_all = pd.read_csv(r"D:\trainafter.csv",index_col=0) #2、目标和特征区分 X = df_table_all.drop(["Y"],axis=1).values Y = np.array(df_table_all["Y"]) #3、按比例切割数据 X_train,X_test,Y_train,Y_test = train_test_split(X,Y,test_size=0.3,random_state=0) #4、样本平衡, st= SMOTETomek() X_train_st,Y_train_st = st.fit_resample(X_train,Y_train) #4、特征选择: #创建特征选择模型 sfm = SelectFromModel(LogisticRegression(penalty='l1',C=1.0,solver="liblinear")) #训练特征选择模型 sfm.fit(X_train,Y_train) #讲数据转换,剩下重要的特征 X_train_tiny = sfm.transform(X_train) X_test_tiny = sfm.transform(X_test) #5、创建模型 model = LogisticRegression(penalty='l1',C=1.0,solver="liblinear") model.fit(X_train_st_tiny,Y_train_st) #6、预测 y_pred = model.predict_proba(X_test_st_tiny) y_cate = model.predict(X_test_st_tiny) c=confusion_matrix(Y_test,y_cate) print(c) def report_auc(y_true,y_prob,title,out_name="",lw=2): fpr,tpr,_=roc_curve(y_true,y_prob,pos_label=1) print(fpr) print(tpr) plt.figure() plt.plot(fpr,tpr,color="darkorange",lw=lw,lable="ROC curve") plt.plot([0,1],[0,1],color="yellow",lw=lw,linestyle="--") plt.xlim([0,1]) plt.ylim([0,1.05]) plt.title(title) plt.legend(loc='lower right') plt.show(0) plt.savefig(r"d:\LR"+out_name,dpi=800) plt.close("all") report_auc(Y_test,y_pred[:,1],"Logistic with L1 panetly",'LG')

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STM32-F0/F1/F2电子库函数UCOS开发指南

资源摘要信息:"本资源专注于提供STM32单片机系列F0、F1、F2等型号的电子库函数信息。STM32系列微控制器是由STMicroelectronics(意法半导体)公司生产,广泛应用于嵌入式系统中,其F0、F1、F2系列主要面向不同的性能和成本需求。本资源中提供的库函数UCOS是一个用于STM32单片机的软件开发包,支持操作系统编程,可以用于创建多任务应用程序,提高软件的模块化和效率。UCOS代表了μC/OS,即微控制器上的操作系统,是一个实时操作系统(RTOS)内核,常用于教学和工业应用中。" 1. STM32单片机概述 STM32是STMicroelectronics公司生产的一系列基于ARM Cortex-M微控制器的32位处理器。这些微控制器具有高性能、低功耗的特点,适用于各种嵌入式应用,如工业控制、医疗设备、消费电子等。STM32系列的产品线非常广泛,包括从低功耗的STM32L系列到高性能的STM32F系列,满足不同场合的需求。 2. STM32F0、F1、F2系列特点 STM32F0系列是入门级产品,具有成本效益和低功耗的特点,适合需要简单功能和对成本敏感的应用。 STM32F1系列提供中等性能,具有更多的外设和接口,适用于更复杂的应用需求。 STM32F2系列则定位于高性能市场,具备丰富的高级特性,如图形显示支持、高级加密等。 3. 电子库函数UCOS介绍 UCOS(μC/OS)是一个实时操作系统内核,它支持多任务管理、任务调度、时间管理等实时操作系统的常见功能。开发者可以利用UCOS库函数来简化多任务程序的开发。μC/OS是为嵌入式系统设计的操作系统,因其源代码开放、可裁剪性好、可靠性高等特点,被广泛应用于教学和商业产品中。 4. STM32与UCOS结合的优势 将UCOS与STM32单片机结合使用,可以充分利用STM32的处理能力和资源,同时通过UCOS的多任务管理能力,开发人员可以更加高效地组织程序,实现复杂的功能。它有助于提高系统的稳定性和可靠性,同时通过任务调度,可以优化资源的使用,提高系统的响应速度和处理能力。 5. 开发环境与工具 开发STM32单片机和UCOS应用程序通常需要一套合适的开发环境,如Keil uVision、IAR Embedded Workbench等集成开发环境(IDE),以及相应的编译器和调试工具。此外,开发人员还需要具备对STM32硬件和UCOS内核的理解,以正确地配置和优化程序。 6. 文件名称列表分析 根据给出的文件名称列表“库函数 UCOS”,我们可以推断该资源可能包括了实现UCOS功能的源代码文件、头文件、编译脚本、示例程序、API文档等。这些文件是开发人员在实际编程过程中直接使用的材料,帮助他们理解如何调用UCOS提供的接口函数,如何在STM32单片机上实现具体的功能。 7. 开发资源和社区支持 由于STM32和UCOS都是非常流行和成熟的技术,因此围绕它们的开发资源和社区支持非常丰富。开发者可以找到大量的在线教程、论坛讨论、官方文档和第三方教程,这些资源可以大大降低学习难度,提高开发效率。对于使用STM32单片机和UCOS的开发者来说,加入这些社区,与其他开发者交流经验,是一个非常有价值的步骤。 综上所述,资源“电子-库函数UCOS.rar”提供了STM32单片机特别是F0、F1、F2系列的UCOS实时操作系统库函数,这些资源对于嵌入式系统开发人员来说,是提高开发效率和实现复杂功能的重要工具。通过理解和运用这些库函数,开发者能够更有效地开发出稳定、高效的嵌入式应用。