在pdb的view features in 3D是不是每次只能看到同源的两个链
时间: 2023-12-14 19:03:17 浏览: 34
在PDB的"View Features in 3D"页面中,通常只会显示与当前链同源的那一条链。这是因为PDB文件中包含了多个蛋白质结构,每个结构都可以包含多个链,但通常只有其中的一部分链与当前链同源。因此,如果需要同时查看多个链的结构,需要进行额外的操作。
如果要查看一个蛋白质结构中的所有链,可以使用Pymol等分子可视化软件。以下是在Pymol中同时显示多个链的示例代码:
```python
# 导入Pymol库
import pymol
# 连接到Pymol服务器
pymol.finish_launching()
# 打开PDB文件
pymol.cmd.load('pdb_file.pdb')
# 显示所有链
pymol.cmd.show('cartoon')
pymol.cmd.show('sticks')
# 旋转和调整视角
pymol.cmd.turn('x', 90)
pymol.cmd.turn('y', 90)
```
在这段代码中,首先连接到Pymol服务器,然后打开PDB文件并显示所有链的结构。最后,可以通过旋转和调整视角来观察不同的链。需要注意的是,Pymol还提供了丰富的可视化和分析工具,可以帮助你更好地理解和分析蛋白质结构。
相关问题
alter pluggable database pdb_name save state; 一个节点跑还是两个节点
如果您使用的是Oracle RAC集群,那么在执行 `ALTER PLUGGABLE DATABASE pdb_name SAVE STATE` 命令时,该命令会在所有节点上执行。这是因为PDB是在整个RAC集群中共享的,因此需要在所有节点上保存PDB的状态。
如果您只想在特定的节点上保存PDB状态,可以在执行命令时使用 `SCOPE` 参数。例如,如果要在节点1上保存PDB状态,可以使用以下命令:
```SQL
ALTER PLUGGABLE DATABASE pdb_name SAVE STATE SCOPE=NODE:node1;
```
请将“pdb_name”替换为您要保存状态的实际PDB名称,将“node1”替换为您要保存状态的节点名称。这将仅在节点1上保存PDB状态。
打两个断点程序在两个断点之间运行
好的,这是一个很简单的问题。首先,在你想要设置第一个断点的代码行前面添加如下代码:
```
import pdb; pdb.set_trace()
```
这将在代码执行到该行时打上一个断点。接下来,在你想要设置第二个断点的代码行前面也添加相同的代码行。然后,运行你的程序。当程序执行到第一个断点时,它将会停止并进入调试模式。你可以在这个模式下查看变量值、执行代码行、以及在代码行之间移动。当你准备好继续程序的执行时,输入 `c` 命令并按回车键,程序将会继续执行直到第二个断点处停止。