用于近红外光谱的PCA可视化matlab代码

时间: 2023-06-17 08:02:31 浏览: 73
以下是用于近红外光谱的PCA可视化的 Matlab 代码: ``` %加载数据 data = load('data.mat'); X = data.X; labels = data.labels; %标准化数据 X_norm = zscore(X); %计算PCA [coeff,score,latent] = pca(X_norm); %可视化前两个主成分 scatter(score(:,1),score(:,2),[],labels,'filled') xlabel('PC1') ylabel('PC2') title('PCA Visualization of NIR Spectra') colorbar ``` 其中,`data.mat` 包含了 N 行 M 列的数据矩阵 `X` 和 N 行 1 列的标签向量 `labels`,可以根据实际情况进行修改。此代码将数据进行标准化,然后计算前两个主成分,并用散点图进行可视化。每个数据点的颜色根据其标签进行分配。
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用于近红外光谱的PCA分类可视化matlab代码

以下是一个简单的使用PCA进行近红外光谱分类可视化的Matlab代码示例: ```matlab % 导入数据 data = importdata('data.csv'); X = data(:, 1:end-1); % 数据矩阵 y = data(:, end); % 标签矩阵 % 标准化数据 X = zscore(X); % 使用PCA进行数据降维 [coeff, score, ~, ~, explained] = pca(X); % 计算累计方差贡献率 cumulative_explained = cumsum(explained); % 取前两个主成分进行可视化 X_pca = score(:, 1:2); % 绘制分类图 gscatter(X_pca(:,1), X_pca(:,2), y); xlabel('PC1'); ylabel('PC2'); title('PCA Classification'); ``` 其中,`data.csv`是包含样本数据和标签的CSV文件,第一列到倒数第二列是特征数据,最后一列是分类标签。该代码首先将数据标准化,然后使用PCA进行降维,并计算累计方差贡献率。最后,将前两个主成分用于可视化,绘制分类图。

用于近红外光谱的PCA分类可视化python代码

以下是用于近红外光谱的PCA分类可视化的Python代码: ```python # 导入必要的库 import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.model_selection import train_test_split # 加载数据集 data = pd.read_csv('spectra.csv') # 将类别列设置为目标变量 X = data.iloc[:, 1:].values y = data.iloc[:, 0].values # 标准化数据 sc = StandardScaler() X_std = sc.fit_transform(X) # 使用PCA进行降维 pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(X_std) # 将降维后的数据与目标变量合并 df = pd.DataFrame({'x': X_pca[:, 0], 'y': X_pca[:, 1], 'label': y}) # 将数据集分为训练集和测试集 X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X_pca, y, test_size=0.3, random_state=0) # 绘制分类可视化图 colors = ['red', 'green', 'blue', 'yellow'] for label, color in zip(df['label'].unique(), colors): mask = df['label'] == label plt.scatter(df[mask]['x'], df[mask]['y'], c=color, label=label) plt.xlabel('PC1') plt.ylabel('PC2') plt.legend() plt.show() ``` 这段代码会读取名为`spectra.csv`的数据集,对数据进行标准化和PCA降维,并将降维后的数据与目标变量合并。然后,它将数据集分为训练集和测试集,并绘制分类可视化图。在分类可视化图中,每个类别使用不同的颜色表示。

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