对豌豆数据作观测值的主成分得分图

时间: 2023-09-03 20:05:52 浏览: 55
很抱歉,我无法生成图像,但我可以为您提供一些步骤和代码,以便您可以自己绘制主成分得分图。 首先,您需要使用豌豆数据集进行主成分分析(PCA)并计算主成分得分。这可以使用Python中的scikit-learn库完成,代码示例如下: ```python from sklearn.decomposition import PCA import pandas as pd # 导入数据 data = pd.read_csv('peas.csv') # 执行主成分分析 pca = PCA(n_components=2) principal_components = pca.fit_transform(data) # 计算主成分得分 scores = pd.DataFrame(principal_components, columns=['PC1', 'PC2']) # 输出前几行 print(scores.head()) ``` 接下来,您可以使用matplotlib库绘制主成分得分图,代码示例如下: ```python import matplotlib.pyplot as plt # 绘制散点图 plt.scatter(scores['PC1'], scores['PC2']) # 添加标题和坐标轴标签 plt.title('PCA Scores Plot for Peas Data') plt.xlabel('PC1') plt.ylabel('PC2') # 显示图像 plt.show() ``` 通过运行上述代码,您将获得豌豆数据集的主成分得分图。
相关问题

对豌豆数据进行主成分分析

好的,进行主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)需要使用数据分析工具,下面以Python语言为例,演示如何对豌豆数据进行主成分分析。 首先,需要导入相关的Python库,如下所示: ```python import numpy as np import pandas as pd from sklearn.decomposition import PCA import matplotlib.pyplot as plt ``` 然后,读取豌豆数据集,代码如下: ```python # 读取豌豆数据集 df = pd.read_csv('https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data', header=None) ``` 接着,将数据集中的特征数据和标签数据进行分离,并对特征数据进行标准化处理,代码如下: ```python # 分离特征数据和标签数据 X = df.iloc[:, 0:4].values y = df.iloc[:, 4].values # 对特征数据进行标准化处理 from sklearn.preprocessing import StandardScaler X = StandardScaler().fit_transform(X) ``` 然后,进行主成分分析,代码如下: ```python # 进行主成分分析 pca = PCA(n_components=2) principalComponents = pca.fit_transform(X) principalDf = pd.DataFrame(data = principalComponents, columns = ['principal component 1', 'principal component 2']) ``` 最后,绘制主成分分析结果图,代码如下: ```python # 绘制主成分分析结果图 fig = plt.figure(figsize = (8,8)) ax = fig.add_subplot(1,1,1) ax.set_xlabel('Principal Component 1', fontsize = 15) ax.set_ylabel('Principal Component 2', fontsize = 15) ax.set_title('2 component PCA', fontsize = 20) targets = ['Iris-setosa', 'Iris-versicolor', 'Iris-virginica'] colors = ['r', 'g', 'b'] for target, color in zip(targets,colors): indicesToKeep = y == target ax.scatter(principalDf.loc[indicesToKeep, 'principal component 1'] , principalDf.loc[indicesToKeep, 'principal component 2'] , c = color , s = 50) ax.legend(targets) ax.grid() ``` 运行上述代码后,即可得到豌豆数据的主成分分析结果图。

如何从分析完的主成分数据中,取出前两个主成分的数据进行绘制主成分得分图。

您可以使用`pca$scores[,1:2]`来提取前两个主成分的得分数据,然后使用这些数据来绘制主成分得分图。以下是一个示例代码: ```R # 假设您已经完成了主成分分析并得到了主成分得分数据 # 假设主成分得分数据为 pca$scores,其中包含多个主成分 # 提取前两个主成分的得分数据 pca_scores <- pca$scores[, 1:2] # 绘制主成分得分图 library(ggplot2) ggplot(pca_scores, aes(x = PC1, y = PC2)) + geom_point() + xlab(paste0("PC1 (", round(pca$importance[2, 1]*100, 2), "%)")) + ylab(paste0("PC2 (", round(pca$importance[2, 2]*100, 2), "%)")) + ggtitle("主成分得分图") ``` 在这个示例中,`pca$importance`变量包含了每个主成分的贡献率。我们使用了`paste0`函数来将贡献率信息与轴标签一起显示在图表上。

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