r语言求出样本相关系矩阵,并从相关系数矩阵出发做出主成分分析,并求出各主成分贡献率及前两个主成分的贡献率,再求出前两个主成分并解释其意义。按第一主成分得分将结果排序
时间: 2023-06-30 18:15:34 浏览: 45
假设样本数据保存在数据框`data`中,可以使用R语言中的`cor()`函数计算样本相关系数矩阵,并用`prcomp()`函数进行主成分分析。代码如下:
```
corr_matrix <- cor(data)
pca <- prcomp(corr_matrix, scale = TRUE)
summary(pca)
```
其中,`scale = TRUE`表示对原始数据进行标准化处理。`summary(pca)`可以输出主成分分析的结果,其中包括各主成分的贡献率。前两个主成分的贡献率可以通过以下代码计算:
```
pca_var <- pca$sdev^2
pca_var_ratio <- pca_var / sum(pca_var)
pca_var_ratio[1:2] # 输出前两个主成分的贡献率
```
其中,`pca_var`表示每个主成分的方差,`pca_var_ratio`表示每个主成分的贡献率。`pca_var_ratio[1:2]`表示输出前两个主成分的贡献率。
要解释前两个主成分的意义,可以通过查看主成分载荷矩阵来实现。主成分载荷矩阵是一个包含每个变量在每个主成分中的权重的矩阵。这个矩阵可以通过以下代码获取:
```
loadings <- pca$rotation
loadings[,1:2] # 输出前两个主成分的载荷矩阵
```
载荷矩阵中的每个元素表示每个变量在对应的主成分中的权重。可以根据这些权重来解释主成分的意义。
最后,可按第一主成分得分将结果排序,可以使用以下代码实现:
```
scores <- pca$x[,1] # 获取第一主成分得分
result <- cbind(data, scores) # 将原始数据和得分合并
result <- result[order(result$scores, decreasing = TRUE),] # 按第一主成分得分降序排序
```
其中,`scores`表示第一主成分的得分,`result`表示将原始数据和得分合并后的结果。`result[order(result$scores, decreasing = TRUE),]`表示按第一主成分得分降序排序。
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