python 计算骨架中轴的距离
时间: 2023-10-25 18:08:22 浏览: 149
edit-distance:Python库,用于计算任意Python序列之间的编辑距离
计算骨架中轴的距离可以使用scikit-image库中的函数`skimage.morphology.medial_axis`和`scipy.spatial.distance.cdist`。
首先,使用`skimage.morphology.medial_axis`函数计算骨架的中轴:
```python
from skimage.morphology import medial_axis
import numpy as np
# 生成一个随机的二值图像骨架
skeleton = np.zeros((100,100))
skeleton[20:80, 20:80] = 1
skeleton[30:70, 30:70] = 0
skeleton = medial_axis(skeleton)
```
接下来,使用`scipy.spatial.distance.cdist`函数计算中轴上每个点之间的距离:
```python
from scipy.spatial.distance import cdist
# 提取中轴上的点坐标
coords = np.column_stack(np.where(skeleton))
# 计算中轴上每个点之间的距离
distances = cdist(coords, coords)
```
这将生成一个`distances`数组,其中第`i`行和第`j`列的元素表示中轴上第`i`个点和第`j`个点之间的距离。可以使用这个数组来计算中轴的总长度:
```python
# 计算中轴的总长度
total_distance = np.sum(distances) / 2
```
注意,由于`distances`数组是对称的,所以需要将总距离除以2。
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