在slurm中, 如何检查GANG调度配置正确,并且提供一个在单个分区执行GANG调度的脚本
时间: 2023-06-17 17:02:12 浏览: 201
dask-jobqueue:在PBS,SLURM和SGE等工作调度程序上部署Dask
要检查GANG调度配置是否正确,可以使用以下命令:
```
sview -G
```
这将显示当前配置的所有GANG分区和节点。
要编写一个在单个分区执行GANG调度的脚本,可以按照以下步骤进行操作:
1. 创建一个新的脚本文件,例如`gang_submit.sh`。
2. 在脚本中设置SLURM选项,如下所示:
```
#!/bin/bash
#SBATCH --partition=<partition_name>
#SBATCH --nodes=<number_of_nodes>
#SBATCH --ntasks-per-node=<number_of_tasks_per_node>
#SBATCH --gres=gpu:<number_of_gpus_per_node>
#SBATCH --job-name=<job_name>
#SBATCH --output=<output_file>
#SBATCH --error=<error_file>
```
其中,`<partition_name>`是要使用的分区的名称,例如`gpu`,`<number_of_nodes>`是要使用的节点数,`<number_of_tasks_per_node>`是每个节点上要运行的任务数,`<number_of_gpus_per_node>`是每个节点上要使用的GPU数,`<job_name>`是作业的名称,`<output_file>`是标准输出文件的名称,`<error_file>`是标准错误文件的名称。
3. 在脚本中添加GANG调度选项,如下所示:
```
#SBATCH --dependency=afterok:<jobid1>:<jobid2>:...
#SBATCH --kill-on-invalid-dep=yes
#SBATCH --clusters=<gang_cluster_name>
#SBATCH --gang
#SBATCH --gang-partition=<gang_partition_name>
#SBATCH --gang-nodes=<gang_number_of_nodes>
#SBATCH --gang-tasks-per-node=<gang_number_of_tasks_per_node>
#SBATCH --gang-gres=gpu:<gang_number_of_gpus_per_node>
```
其中,`<jobid1>:<jobid2>:...`是需要等待的前置作业的ID列表,`<gang_cluster_name>`是GANG集群的名称,`<gang_partition_name>`是要使用的GANG分区的名称,`<gang_number_of_nodes>`是要使用的GANG节点数,`<gang_number_of_tasks_per_node>`是每个GANG节点上要运行的任务数,`<gang_number_of_gpus_per_node>`是每个GANG节点上要使用的GPU数。
4. 在脚本中添加要运行的命令,例如:
```
srun python my_script.py
```
这将在GANG调度下运行`my_script.py`。
5. 提交作业,例如:
```
sbatch gang_submit.sh
```
这将提交GANG调度作业并将其添加到队列中。
请注意,GANG调度只能在支持GANG的分区上运行。在提交GANG调度作业之前,请确保已在`slurm.conf`文件中正确配置了GANG分区和节点。
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