给我一个cox frailty model的R语言代码
时间: 2023-07-10 10:41:36 浏览: 58
Cox Frailty Model 是使用 Cox 比例风险模型来考虑个体之间的随机差异。下面是一个 Cox Frailty Model 的 R 代码示例:
```R
library(survival)
library(coxme)
# 读取数据
data <- read.csv("data.csv")
# 拟合 Cox Frailty Model
cox_model <- coxme(Surv(time, status) ~ age + sex + treatment + (1 | subject), data = data)
# 查看模型摘要
summary(cox_model)
# 计算 Hazard Ratio 和 95% CI
HR <- exp(coef(cox_model)["treatment"])
CI <- exp(confint(cox_model)["treatment", ])
# 输出结果
cat("Hazard Ratio (95% CI):", round(HR, 2), "(", round(CI[1], 2), "-", round(CI[2], 2), ")")
```
在这个代码中,我们使用了 survival 和 coxme 包来拟合 Cox Frailty Model。我们使用了 coxme() 函数来拟合模型,指定了时间和事件状态作为响应变量,以及年龄、性别和治疗作为解释变量。在公式中,我们使用了 "(1 | subject)" 来指定 Frailty 随机截距项。
在计算 Hazard Ratio 和 95% CI 时,我们使用了 coef() 函数来提取回归系数,使用 confint() 函数来计算置信区间。最后,我们使用 cat() 函数来将结果输出。
请注意,这只是一个 Cox Frailty Model 的示例代码,具体的代码和模型设置可能会因研究问题而异。