def CF_find_alpha(seq): """Find all likely alpha helices in sequence. Returns a list of [start,end] pairs for the alpha helices.""" start = 0 results = [] # Try each window while (start + 6 < len(seq)): # Count the number of "good" amino acids (those likely to be # in an alpha helix). numgood = 0 for i in range(start, start+6): if (Pa[seq[i]] > 100): numgood = numgood + 1 if (numgood >= 4): [estart,end] = CF_extend_alpha(seq, start, start+6) #print "Exploring potential alpha " + str(estart) + ":" + str(end) #if (CF_good_alpha(seq[estart:end])): if [estart,end] not in results: results.append([estart,end]) # Go on to the next frame start = start + 1 # That's it, we're done return results修改这个脚本

这这是这是一个这是一个函数这是一个函数，这是一个函数，名这是一个函数，名为这是一个函数，名为CF这是一个函数，名为CF_find这是一个函数，名为CF_find_alpha这是一个函数，名为CF_find_alpha，这是一个函数，名为CF_find_alpha，用这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结构这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结构的这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结构的起这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结构的起点这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结构的起点和这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结构的起点和终这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结构的起点和终点这是一个函数，名为CF_find_alpha，用于在一个蛋白质序列中寻找可能的α-螺旋结构，并返回它们的起点和终点，返回结果为一个列表变量。函数的主体部分包含起点start的初始化和使用列表变量results存储α-螺旋结构的起点和终点。