model_cross2<- glm(vote ~ selfLR+ClinLR+DoleLR+PID+selfLR*ClinLR+selfLR*DoleLR, data = data, family = "binomial")如何利用10折交叉验证的方法计算该模型的预测准确率,auc值,roc曲线
时间: 2023-12-20 21:03:18 浏览: 106
ROC曲线AUC计算
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首先,我们需要将数据集划分为10个互斥的子集,可以使用函数`createDataPartition()`或`sample()`进行随机划分。然后,对于每个子集,在剩余9个子集上训练模型,并在该子集上进行测试,得出预测准确率和AUC值。最后,将10次测试结果的平均值作为最终的预测准确率和AUC值。
以下是一个可能的代码实现:
```R
library(pROC)
# 划分数据集为10个子集
set.seed(123)
folds <- createFolds(data$vote, k = 10, list = TRUE)
# 定义交叉验证函数
cv <- function(data, folds) {
acc <- numeric(length(folds))
auc <- numeric(length(folds))
for (i in seq_along(folds)) {
# 划分训练集和测试集
train <- data[-folds[[i]], ]
test <- data[folds[[i]], ]
# 训练模型
model <- glm(vote ~ selfLR+ClinLR+DoleLR+PID+selfLR*ClinLR+selfLR*DoleLR, data = train, family = "binomial")
# 预测测试集
pred <- predict(model, test, type = "response")
# 计算预测准确率
acc[i] <- mean(ifelse(pred > 0.5, 1, 0) == test$vote)
# 计算AUC值
auc[i] <- roc(test$vote, pred)$auc
}
# 返回预测准确率和AUC值的平均值
return(list(acc = mean(acc), auc = mean(auc)))
}
# 进行交叉验证
results <- cv(data, folds)
# 输出结果
cat("预测准确率:", round(results$acc, 4), "\n")
cat("AUC值:", round(results$auc, 4), "\n")
# 绘制ROC曲线
plot(roc(data$vote, predict(model_cross2, type = "response")), col = "blue")
```
注意,上述代码中的`pROC`包提供了计算AUC值和绘制ROC曲线的函数。如果没有安装该包,可以使用以下命令进行安装:
```R
install.packages("pROC")
```
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