model_cross2 <- glm(vote ~ selfLR+ClinLR+DoleLR+PID+selfLR:ClinLR+selfLR:DoleLR, data = train_data, family = "binomial")如何用r语言输出该模型的g^2,x^2以及p值
时间: 2023-12-21 13:04:17 浏览: 23
要输出该模型的 g^2, x^2 和 p 值,可以使用以下代码:
```r
library(survey)
# 构建带权重的数据
train_design <- svydesign(ids = ~1, weights = ~weight, data = train_data)
# 计算 g^2 和 x^2
g2 <- summary(model_cross2, test = "Chisq")$statistics["Deviance", "value"]
x2 <- summary(model_cross2, test = "Chisq")$statistics["Pearson", "value"]
# 计算 p 值
p_value <- pchisq(g2, df = model_cross2$df.residual, lower.tail = FALSE)
```
其中,`svydesign()` 函数用于构建带权重的数据,`summary()` 函数用于计算 g^2 和 x^2,`pchisq()` 函数用于计算 p 值。最后得到的 `g2`、`x2` 和 `p_value` 分别是该模型的 g^2 统计量、x^2 统计量和 p 值。
相关问题
model_cross2<- glm(vote ~ selfLR+ClinLR+DoleLR+PID+selfLR*ClinLR+selfLR*DoleLR, data = data, family = "binomial")如何利用10折交叉验证的方法计算该模型的预测准确率,auc值,roc曲线
首先,我们需要将数据集划分为10个互斥的子集,可以使用函数`createDataPartition()`或`sample()`进行随机划分。然后,对于每个子集,在剩余9个子集上训练模型,并在该子集上进行测试,得出预测准确率和AUC值。最后,将10次测试结果的平均值作为最终的预测准确率和AUC值。
以下是一个可能的代码实现:
```R
library(pROC)
# 划分数据集为10个子集
set.seed(123)
folds <- createFolds(data$vote, k = 10, list = TRUE)
# 定义交叉验证函数
cv <- function(data, folds) {
acc <- numeric(length(folds))
auc <- numeric(length(folds))
for (i in seq_along(folds)) {
# 划分训练集和测试集
train <- data[-folds[[i]], ]
test <- data[folds[[i]], ]
# 训练模型
model <- glm(vote ~ selfLR+ClinLR+DoleLR+PID+selfLR*ClinLR+selfLR*DoleLR, data = train, family = "binomial")
# 预测测试集
pred <- predict(model, test, type = "response")
# 计算预测准确率
acc[i] <- mean(ifelse(pred > 0.5, 1, 0) == test$vote)
# 计算AUC值
auc[i] <- roc(test$vote, pred)$auc
}
# 返回预测准确率和AUC值的平均值
return(list(acc = mean(acc), auc = mean(auc)))
}
# 进行交叉验证
results <- cv(data, folds)
# 输出结果
cat("预测准确率:", round(results$acc, 4), "\n")
cat("AUC值:", round(results$auc, 4), "\n")
# 绘制ROC曲线
plot(roc(data$vote, predict(model_cross2, type = "response")), col = "blue")
```
注意,上述代码中的`pROC`包提供了计算AUC值和绘制ROC曲线的函数。如果没有安装该包,可以使用以下命令进行安装:
```R
install.packages("pROC")
```
model <- glm(y ~ x1 + x2, data = data, family = binomial)各个都是什么意思、
这行代码是用来拟合一个广义线性模型(Generalized Linear Model,简称GLM)。具体来说,它表示的是:
1. y ~ x1 + x2:使用y作为因变量,x1和x2作为自变量,建立一个线性模型。
2. data = data:指定数据集为data。
3. family = binomial:指定模型的误差分布为二项分布,这是因为y是一个二元变量(只有0和1两种取值)。
因此,这行代码的含义是:在数据集data中,使用x1和x2作为解释变量,y作为响应变量,拟合一个二项式广义线性模型。
其中,glm()函数是用来拟合GLM模型的函数,它的第一个参数是一个公式,用来指定模型的形式。数据集可以通过第二个参数data指定,而family参数用来指定模型的误差分布。在这个例子中,我们使用了二项分布作为误差分布。