写一个严谨的python脚本，不依赖模块提取cds文件中最长转录本输出

您好！感谢您选择使用ChitGPT来进行对话。关于您的问题，以下是一个用Python语言编写的脚本，能够提取cds文件中最长转录本并输出。

请注意，本脚本并不依赖于任何模块，并且在默认情况下，输入文件名为“example.cds”，输出文件名为“output.txt”。您可以根据需要进行修改。

# 定义函数，用于计算转录本长度
def calculate_length(sequence):
length = 0
for char in sequence:
if char == 'A' or char == 'T' or char == 'G' or char == 'C':
length += 1
return length

# 读取输入文件
input_file = open('example.cds', 'r')
cds_sequence = input_file.read().strip()
input_file.close()

# 根据 '>' 分隔多个序列
cds_sequence_list = cds_sequence.split('>')[1:]

# 初始化变量
longest_transcript = ''
longest_length = 0

# 遍历每个序列
for sequence in cds_sequence_list:
sequence = sequence.split('\n')[1:] # 去除标识行
sequence = ''.join(sequence) # 将序列行合并为一个序列
transcript_list = sequence.split('TAA')[:-1] # 根据终止密码子分割序列
for transcript in transcript_list:
length = calculate_length(transcript)
if length > longest_length:
longest_length = length
longest_transcript = transcript

# 将最长转录本输出到文件中
output_file = open('output.txt', 'w')
output_file.write(longest_transcript)
output_file.close()

希望以上代码能够满足您的需求！如果您还有任何疑问，欢迎继续与我交流。