对多重插补后的数据进行广义加性模型,并计算rr
时间: 2024-03-20 20:43:51 浏览: 154
可以使用mgcv(Mixed GAM Computation Vehicle)包拟合广义加性模型,然后计算相应的RR值。下面是一个示例代码:
```R
#加载mgcv包
library(mgcv)
#拟合广义加性模型
fit <- gam(x3 ~ s(x1) + s(x2), data = complete_data)
#计算RR值
rr <- exp(coef(fit)["s(x2)"]) / exp(coef(fit)["s(x1)"])
```
在上面的示例代码中,我们首先加载了mgcv包,并使用complete函数获取了插补后的完整数据集。然后,使用gam函数拟合广义加性模型,其中s函数表示对变量进行平滑处理。最后,通过计算模型中两个平滑项系数的比值,得到了RR值。
相关问题
多重插补后进行广义加性模型
进行广义加性模型(GAM)时,可以使用多重插补后的数据集进行模型拟合。以下是一个使用R语言中的mgcv包进行GAM拟合的示例代码:
```R
# 加载mgcv包
library(mgcv)
# 读取插补后的数据
imputed_data <- read.csv("imputed_data.csv")
# 拟合GAM模型
gam_model <- gam(y ~ s(x1) + s(x2) + x3, data = imputed_data)
# 查看模型摘要
summary(gam_model)
```
其中,y表示响应变量,x1、x2、x3表示解释变量,s()函数表示对变量进行光滑处理,data表示数据集。在进行模型拟合时,可以像使用完整数据集一样使用多重插补后的数据集。需要注意的是,如果插补后的数据集中仍存在缺失数据,需要再次进行插补处理。
汇总多重插补后的每个数据集的广义加性模型结果,并计算rr
可以使用mice包中的pool函数对多重插补后的每个数据集的广义加性模型结果进行汇总,然后计算相应的RR值。下面是一个示例代码:
```R
#加载mice包
library(mice)
#创建一个含有缺失值的数据集
data <- data.frame(x1 = c(1, 2, NA, 4, 5),
x2 = c(NA, 2, 3, NA, 5),
x3 = c(1, 2, 3, NA, 5))
#进行多重插补
imputed_data <- mice(data, m = 5, maxit = 50, meth = c("pmm", "pmm", "pmm"))
#拟合广义加性模型并汇总
fit_list <- with(imputed_data, list(gam(x3 ~ s(x1) + s(x2), data = complete(imputed_data, 1)),
gam(x3 ~ s(x1) + s(x2), data = complete(imputed_data, 2)),
gam(x3 ~ s(x1) + s(x2), data = complete(imputed_data, 3)),
gam(x3 ~ s(x1) + s(x2), data = complete(imputed_data, 4)),
gam(x3 ~ s(x1) + s(x2), data = complete(imputed_data, 5))))
fit_pool <- pool(fit_list)
#计算RR值
rr <- exp(coef(fit_pool)["s(x2)"]) / exp(coef(fit_pool)["s(x1)"])
```
在上面的示例代码中,我们首先加载了mice包,并创建了一个包含缺失值的数据集。然后,使用mice函数对数据进行多重插补,并使用complete函数获取了插补后的完整数据集。接着,针对每个完整数据集,使用gam函数拟合了广义加性模型,并将每个模型的结果存储在一个列表中。最后,使用pool函数对模型结果进行汇总,并通过计算汇总后模型中两个平滑项系数的比值,得到了RR值。
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