限制性立方样条横坐标为CESD-10抑郁评分,纵坐标为脑卒中,当CESD-10为10时设OR值为1,问相应的R语言代码
时间: 2024-11-06 20:17:47 浏览: 15
线性、logistic、cox限制性立方样条图使用的数据
在R语言中,如果要用限制性立方样条(RCS)来展示 CESD-10 抑郁评分(Continuous Emotional Stress Disorder - 10-item scale)与脑卒中(stroke)之间的关系,并且希望在 CESD-10评分为10分时,对应的OR值为1(表示这个分数对脑卒中的影响为零),可以使用`mgcv`包的`te()`函数,结合`gam()`函数建立逻辑斯蒂回归模型。这里假设你已经有了名为`data`的数据框,其中包含了`cesd_10`(CESD-10抑郁评分)和`stroke`(脑卒中状态)的变量。以下是相关的R代码示例:
```R
library(mgcv)
library(scales) # 用于处理数值标签
# 假设cesd_10是以连续形式存储的
data$log_or_at_cesd_10 = 0 # 初始化OR值为1的地方的对数OR值
# 创建RCS基础函数
basis cesd_10 <- ns(data$cesd_10, df = 4, Boundary.knots = c(0, 10, Inf))
# 使用gam函数创建模型,指定OR值在cesd_10=10时为1
model <- gam(stroke ~ te(cesd_10, basis, by = log_or_at_cesd_10),
family = binomial(link = "logit"), data = data)
# 可视化模型结果
plot(model, se = TRUE, rug = TRUE,
xlab = "CESD-10抑郁评分", ylab = "脑卒中发生概率",
xlim = c(0, 20)) # 将x轴范围设为0到20,因为 CESD-10 一般不超过20分
# 查看模型在cesd_10=10时的OR值
exp(coef(model)["cesd_10"] + model$offset[which(data$cesd_10 == 10)]) # 对数OR转为OR
```
请注意,在实际应用中,由于逻辑回归OR值与截距的关系,为了在特定点设置OR为1,可能需要通过调整截距(offset)来实现,而不是直接修改预测变量的系数。
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