python绘制核密度3d图
时间: 2023-06-30 11:04:49 浏览: 214
要绘制核密度的3D图,可以使用Python中的Mayavi库。下面是一个简单的例子:
```python
import numpy as np
from scipy.stats import kde
from mayavi import mlab
# 创建测试数据
x, y, z = np.random.normal(size=(3, 10000))
# 计算核密度估计
kernel = kde.gaussian_kde([x, y, z])
density = kernel([x, y, z])
# 绘制3D图
figure = mlab.figure('DensityPlot')
points = mlab.points3d(x, y, z, density, scale_mode='none', scale_factor=0.07)
mlab.axes()
mlab.show()
```
在这个例子中,我们首先创建了一个包含10000个随机数的三维数据集。然后,我们使用Scipy库中的核密度估计函数计算数据集的核密度。最后,我们使用Mayavi库中的函数绘制3D图。
请注意,Mayavi库需要先安装,可以通过以下命令进行安装:
```
pip install mayavi
```
这个例子只是一个简单的演示,如果需要更高级的功能,可以参考Mayavi库的官方文档。
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利用Python绘制氢原子3d态电子云图样
你可以使用Python中的matplotlib和mayavi库来绘制氢原子3D态电子云图样。首先,你需要安装这两个库。然后使用以下代码:
```python
# 导入必要的库
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
from mayavi import mlab
# 创建一个3D图形窗口
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
# 定义氢原子自旋函数,其中r是原子核与电子之间的距离
def hydrogen_wave_func(n, l, m, r, theta, phi):
a = 1 # 常数,实际数值为玻尔半径
# 计算球谐函数和径向函数
Y_lm = np.real(scipy.special.sph_harm(m, l, phi, theta))
R_nl = (2 / (n * a))**3 * scipy.special.factorial(n - l - 1) / (2 * n * scipy.special.factorial(n + l)) * np.exp(-r / (n * a)) * (2 * r / (n * a))**l * scipy.special.eval_legendre(n - l - 1, 2 * l + 1)(2 * r / (n * a))
return np.abs(R_nl * Y_lm)**2
# 定义要绘制的n, l, m值
n_values = [1, 2] # n
l_values = [0, 1] # l
m_values = [-1, 0, 1] # m
# 定义绘图的范围
r = np.linspace(0, 20, 50)
theta = np.linspace(0, np.pi, 50)
phi = np.linspace(0, 2 * np.pi, 50)
R, Theta, Phi = np.meshgrid(r, theta, phi)
# 循环绘图
for n in n_values:
for l in l_values:
for m in m_values:
# 计算电子密度函数
psi = hydrogen_wave_func(n, l, m, R, Theta, Phi)
# 绘制3D图像
x = R * np.sin(Theta) * np.cos(Phi)
y = R * np.sin(Theta) * np.sin(Phi)
z = R * np.cos(Theta)
ax.plot_surface(x, y, z, rstride=1, cstride=1, facecolors=plt.cm.jet(psi))
# 显示图像
plt.show()
```
用python语言绘制出三维核密度估计图
要在Python中绘制三维核密度估计图,可以使用SciPy库中的`gaussian_kde`函数和Matplotlib库中的`Axes3D`模块。
下面是一个示例代码,用于生成随机三维数据并绘制其核密度估计图:
```python
import numpy as np
from scipy.stats import gaussian_kde
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
# 生成随机三维数据
x = np.random.normal(size=1000)
y = np.random.normal(size=1000)
z = np.random.normal(size=1000)
# 计算核密度估计
density = gaussian_kde([x, y, z])
# 创建图表对象
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
# 生成网格点
xmin, ymin, zmin = x.min(), y.min(), z.min()
xmax, ymax, zmax = x.max(), y.max(), z.max()
xi, yi, zi = np.mgrid[xmin:xmax:100j, ymin:ymax:100j, zmin:zmax:100j]
positions = np.vstack([xi.ravel(), yi.ravel(), zi.ravel()])
# 计算密度值
values = np.reshape(density(positions).T, xi.shape)
# 绘制三维核密度估计图
ax.scatter(x, y, z, alpha=0.1, s=5)
ax.contour3D(xi, yi, zi, values, 100, cmap='viridis')
ax.set_xlabel('X')
ax.set_ylabel('Y')
ax.set_zlabel('Z')
plt.show()
```
运行以上代码,就可以得到一个随机三维数据的核密度估计图。
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