R语言梯度提升机如何输出概率
时间: 2023-10-23 20:12:03 浏览: 148
R语言临床预测模型分享
对于这个问题,我可以给出以下的回答:
在 R 语言中,梯度提升机(Gradient Boosting Machine,GBM)主要有两种实现方式,一种是使用 gbm 包,另一种是使用 xgboost 包。
对于 gbm 包而言,要输出概率需要将参数 distribution 设置为“bernoulli”,同时设置 predict函数的 type 参数为“response”,例如:
```{r}
library(gbm)
set.seed(1234)
data(iris)
# 使用 GBM 模型进行二分类
gbm.mod <- gbm(Species ~ ., data = iris, distribution = "bernoulli",
n.trees = 5000, interaction.depth = 3, shrinkage = 0.02)
# 预测概率
gbm.prob <- predict(gbm.mod, newdata = iris, type = "response")
# 输出结果
head(gbm.prob)
```
对于 xgboost 包而言,也需要设置相应的参数,例如:
```{r}
library(xgboost)
set.seed(1234)
data(iris)
iris$Species <- as.numeric(as.factor(iris$Species)) - 1
# 转换数据格式
data.matrix <- as.matrix(iris[, 1:4])
# 定义参数
xgb.params <- list(objective = "binary:logistic", max_depth = 3, eta = 0.02, nthread = 2,
nrounds = 5000, verbose = 0, eval_metric = "auc")
# 训练模型
xgb.mod <- xgboost(data.matrix, label = iris$Species, params = xgb.params)
# 预测概率
xgb.prob <- predict(xgb.mod, newdata = data.matrix)
# 输出结果
head(xgb.prob)
```
以上回答仅供参考,具体情况还需根据具体的数据和建模方法进行调整。
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