在使用pyinstaller打包好一个执行文件后出现Error in file(file, "rt") : 无法打开链结 Calls: read.csv -> read.table -> file 此外: Warning message: In file(file, "rt") : 无法打开文件'query.csv': No such file or directory

这个错误提示意味着程序无法找到名为'query.csv'的文件。如果这个文件是你的程序所需要的，但是在打包后无法找到，那么可能是因为打包的时候没有将这个文件包含在内。

你可以检查一下打包的时候是否将该文件包含进去了，具体方法取决于你使用的打包工具。如果是使用PyInstaller打包的话，可以在运行命令时加上"--add-data"参数，例如:

pyinstaller --add-data 'path/to/query.csv:.' yourscript.py

这会将'path/to/query.csv'文件打包到可执行文件的根目录中。如果文件不在根目录，你可以将"."改为相对路径或绝对路径。

如果你已经将文件包含进去了，但是仍然出现这个错误，那么可能是程序在运行时无法找到文件。你可以检查一下程序中读取该文件的代码，确保文件路径是正确的。