主成分分析碎石图_Plotting PCA (主成分分析详细完美补充!!!!)
时间: 2023-07-06 12:35:41 浏览: 120
backtrader_plotting:为 backtrader 绘制插件以支持 Bokeh(也许更多)
好的,我来解答你的问题。首先,主成分分析(PCA)是一种常用的数据降维技术,可以将高维数据转换为低维数据,并尽可能地保留原始数据的信息。在PCA中,我们会将数据投影到由主成分构成的新的坐标系中,其中每个主成分代表了原始数据中的一个方向,这些主成分按照方差大小排序,方差越大的主成分越重要。
下面是如何使用Python中的scikit-learn库进行PCA和绘制PCA碎石图(Scree Plot)的详细步骤:
1. 导入必要的库和数据集
```
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
```
2. 标准化数据
```
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
X = StandardScaler().fit_transform(X)
```
3. 计算PCA
```
pca = PCA(n_components=4)
principalComponents = pca.fit_transform(X)
```
4. 绘制PCA碎石图
```
plt.plot(np.cumsum(pca.explained_variance_ratio_))
plt.xlabel('Number of Components')
plt.ylabel('Cumulative Explained Variance')
plt.show()
```
其中,np.cumsum(pca.explained_variance_ratio_)计算出了每个主成分的方差贡献率的累计和。
运行上述代码后,你会得到一个PCA碎石图,可以帮助你选择保留多少个主成分。在这个图中,每个主成分对应的方差贡献率越大,则越需要保留这个主成分。你可以根据自己的需求选择要保留的主成分数量,然后将主成分投影到新的坐标系中,进而进行后续的数据分析。
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