python 计算骨架中轴与两侧的距离
时间: 2023-11-04 19:09:42 浏览: 194
计算骨架中轴与两侧的距离可以通过以下步骤实现:
1. 使用骨架提取算法提取骨架。
2. 计算骨架中心线或中轴线,可以使用距离变换(distance transform)方法或骨架化(skeletonization)方法。
3. 对于每个中心线上的点,计算其到两侧最近骨架点的距离。可以使用kd树或最近邻算法来计算距离。
以下是一个示例代码:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial import cKDTree
# 骨架提取
skeleton = skeletonize(image)
# 计算距离变换
distance = ndimage.distance_transform_edt(skeleton)
# 计算中轴线
centerline = np.zeros_like(skeleton)
centerline[distance > 0] = 1
centerline = skeletonize(centerline)
# 计算中轴线的每个点到两侧的距离
distances = []
for point in np.transpose(np.nonzero(centerline)):
x, y = point
left_points = np.transpose(np.nonzero(skeleton[:x, :]))
right_points = np.transpose(np.nonzero(skeleton[x+1:, :])) + np.array([x+1, 0])
tree_left = cKDTree(left_points)
tree_right = cKDTree(right_points)
left_distance, _ = tree_left.query(np.array([x, y]))
right_distance, _ = tree_right.query(np.array([x, y]))
distances.append((left_distance, right_distance))
```
在上面的示例代码中,我们首先使用 `skeletonize` 函数提取二值图像的骨架,然后使用 `ndimage.distance_transform_edt` 函数计算距离变换,得到二值图像中每个像素到最近非零像素的距离。接着,我们使用 `skeletonize` 函数计算距离变换的中轴线。对于中轴线上的每个点,我们使用 `cKDTree` 类建立其左侧和右侧非零像素的kd树,并使用 `query` 函数计算到最近像素的距离。最终,我们得到的 `distances` 列表包含了中轴线上每个点到左侧和右侧最近像素的距离。
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