如何用R绘制cox回归中ROC曲线
时间: 2023-11-28 09:50:58 浏览: 895
ROC曲线绘制
在R中绘制Cox回归的ROC曲线通常有两种方法。下面分别介绍这两种方法。
方法一:使用survivalROC包
1. 安装survivalROC包(如果没有安装的话)。
```
install.packages("survivalROC")
```
2. 导入需要的库。
```
library(survival)
library(survivalROC)
```
3. 用coxph函数拟合Cox回归模型。
```
fit <- coxph(Surv(time, status) ~ age + sex + treatment, data = mydata)
```
4. 使用roc函数计算ROC曲线。
```
roc.fit <- survivalROC(fit, estimator = "km")
```
5. 使用plot函数绘制ROC曲线。
```
plot(roc.fit, col = "red")
```
方法二:手动计算并绘制ROC曲线
1. 导入需要的库。
```
library(survival)
library(pROC)
```
2. 用coxph函数拟合Cox回归模型。
```
fit <- coxph(Surv(time, status) ~ age + sex + treatment, data = mydata)
```
3. 计算预测值和真实值。
```
predictors <- predict(fit, newdata = mydata, type = "lp")
response <- mydata$status
```
4. 使用roc函数计算ROC曲线。
```
roc.fit <- roc(response, predictors)
```
5. 使用plot函数绘制ROC曲线。
```
plot(roc.fit, col = "red")
```
以上两种方法均可以绘制Cox回归的ROC曲线,具体使用哪种方法取决于个人的喜好和实际情况。
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