mx = nib.load(im).get_data().max(axis=0).max(axis=0).max(axis=0) data[it, 0, :, :, :] = np.array(nib.load(im).get_data()) / mx
时间: 2024-06-04 14:06:34 浏览: 8
这段代码的作用是将一个3D图像文件加载进来,然后将其归一化到0到1之间,并将其存储到一个3D的numpy数组中。具体来说,第一行代码使用nibabel库中的load函数将3D图像文件加载进来,并使用max函数计算了该图像在x、y、z三个方向上的最大值。第二行代码中,使用了相同的load函数将图像文件加载进来,并使用get_data函数将其转换为numpy数组。接下来的操作是将数组中的值除以之前计算得出的最大值,以将其归一化到0到1之间。最后,将归一化后的数组存储到一个3D数组中。其中,it是一个迭代变量,表示当前处理的图像在数据集中的编号。此代码段的作用在于为深度学习模型提供输入数据。
相关问题
for it, im in tqdm(enumerate(metadata[smc_mask].Path.values), total=smc_mask.sum(), desc='Reading MRI to memory'): mx = nib.load(im).get_data().max(axis=0).max(axis=0).max(axis=0) data[it, 0, :, :, :] = np.array(nib.load(im).get_data()) / mx
这段代码是在使用tqdm库中的enumerate方法遍历metadata中的smc_mask路径,然后读取MRI数据到内存中,并将其归一化到0-1范围内。具体来说,对于每个路径,它首先通过nib.load方法读取MRI数据,然后通过max(axis=0).max(axis=0).max(axis=0)方法找到数据中最大的值,并将其作为归一化分母mx。最后,将MRI数据除以mx并保存在data数组中。这段代码的目的是为了将MRI数据加载到内存中,以便后续的处理和分析。
代码解析flair = nib.load(flair).get_fdata()
这行代码是使用`nib`库加载一个NIfTI格式的图像文件,并获取其图像数据。
解析该行代码的步骤如下:
1. `nib.load(flair)`:使用`nib`库的`load`函数加载图像文件。`flair`是图像文件的路径或文件对象。这里假设`flair`是一个包含图像文件路径的变量。返回的结果是一个代表图像的NIfTI对象。
2. `.get_fdata()`:对加载的NIfTI对象调用`get_fdata()`方法,以获取图像数据。该方法会返回一个包含图像数据的NumPy数组。
因此,整个代码行的作用是将NIfTI格式的图像文件加载到内存中,并将其图像数据存储在名为`flair`的变量中,该变量被认为是NumPy数组。你可以使用这个数组进行进一步的图像处理和分析。
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