代码：r语言用for循环实现padj

由于没有提供数据，我假设您想在 R 中使用 for 循环计算 padj。

假设您有一个矩阵 `data`，其中每行是一个基因的表达数据。您可以使用以下代码来计算 padj：

# 假设您已经计算了差异表达分析结果，结果存储在 data 中
# data 包含基因名称、fold change、p-value 等信息

# 计算初始的 padj
data$padj <- p.adjust(data$pvalue, method = "BH")

# 循环计算 padj，直到没有新的基因被标记为显著差异表达基因
while (any(data$padj <= 0.05)) {
  # 找到当前未标记为显著差异表达基因的基因中，p-value 最小的基因
  min_pvalue_gene <- which.min(data$pvalue[data$padj > 0.05])
  # 将该基因标记为显著差异表达基因
  data$padj[min_pvalue_gene] <- p.adjust(min(data$pvalue[min_pvalue_gene], data$pvalue[data$padj <= 0.05]), method = "BH")
}

# 最终得到的 padj 存储在 data$padj 中

这个循环的思路是每次把当前未标记为显著差异表达基因中的 p-value 最小的基因标记为显著差异表达基因，并重新计算 padj。这个过程会一直重复，直到没有新的基因被标记为显著差异表达基因为止。这个循环的时间复杂度较高，不适合处理大规模的数据。如果您的数据规模较大，建议使用更高效的计算方法。