for i in *.faa; do iqtree -s $i -output $i.treefile -nt 200 -m AVX512;done
时间: 2024-03-29 19:35:33 浏览: 51
jdk-8u91-linux-i586.tar.gz
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这也是一个Linux命令行中的循环语句,用于对当前目录下的所有.faa文件进行基于最大似然法的进化树构建。具体过程是使用iqtree软件对每个.faa文件进行进化树构建,并将结果输出到以原文件名为基础的新文件中。每个新文件的文件名为原文件名加上“.treefile”后缀。其中,选项“-nt 200”指定使用200个线程进行计算,“-m AVX512”指定使用AVX512指令集进行计算,以提高计算速度和效率。
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