Error in env$pred[, "lwr"] : incorrect number of dimensions

这个错误是因为预测结果env$pred不是一个数据框或矩阵，而是一个向量。在这种情况下，可以使用predict函数的intervals参数来指定返回预测结果的置信区间。以下是修正后的代码示例：

# 预测log(ratio)的值和置信区间
pred <- predict(m13, level=0.95, intervals="confidence")
lwr <- pred[, "lwr"]
upr <- pred[, "upr"]

# 将预测结果和置信区间添加到数据框
env$pred <- pred[, "fit"]
env$lwr <- lwr
env$upr <- upr

# 绘制散点图和预测值
ggplot(env, aes(x=treeFD, y=log(ratio))) + 
  geom_point() + 
  geom_line(aes(y=pred), color="red") + 
  geom_ribbon(aes(ymin=lwr, ymax=upr), alpha=0.2, fill="red") + 
  xlab("Tree Functional Diversity") + 
  ylab("Log Ratio")

在预测时，需要使用intervals参数指定预测的置信区间类型（此处为"confidence"），并将结果存储在pred变量中。然后，可以从pred变量中提取fit、lwr和upr变量，并将它们添加到数据框中。最后，可以使用geom_ribbon函数添加置信区间，并指定aes函数中的ymin和ymax参数分别对应lwr和upr变量。其他细节和之前的散点图类似。