PBS查看预计运行时间
时间: 2023-11-25 18:24:30 浏览: 42
PBS提供了几种方法来查看预计运行时间:
1. 使用qstat命令查看队列中所有作业的状态和预计运行时间。使用以下命令:qstat -f
2. 使用qstat -f命令加上作业ID来查看特定作业的状态和预计运行时间。例如,qstat -f 12345
3. 在提交作业时,可以使用-l walltime参数指定作业的最大运行时间。这个参数可以帮助你预测作业的运行时间。
请注意,预计运行时间只是一个估计值,实际运行时间可能会受到许多因素的影响,比如作业的大小、资源的可用性、网络负载等。因此,在提交作业时,你应该留出一些余地,以确保作业能够正常完成。
相关问题
pbs查看队列详细信息
要查看PBS队列的详细信息,可以使用以下命令:
```
qstat -f
```
这将显示当前集群中所有作业的详细信息,包括作业ID,作业状态,作业提交时间,作业运行时间,作业节点,作业资源使用情况等。
您还可以使用以下命令来查看特定队列的详细信息:
```
qstat -Q <queue_name> -f
```
其中,<queue_name>是您要查看详细信息的队列名称。
pbs python
PBS是Portable Batch System的缩写,是一种用于管理和调度计算任务的系统。在PBS中,可以使用脚本来定义和提交任务。脚本中包含了一系列的指令,用于指定任务的名称、所需的资源(如CPU和内存)、要运行的命令等。[1]
在引用[1]中的示例中,脚本使用了PBS的指令来定义任务名称(#PBS -N mutation)和请求的资源(#PBS -l select=2:ncpus=5:mem=4gb)。然后,脚本中使用了ls和cat命令来执行一些操作,并将结果输出到test.txt文件中。
在引用[2]中的示例中,脚本使用了PBS的指令来定义任务名称(#PBS -N mytask)和请求的资源(#PBS -l ncpus=5:mem=90gb)。
在引用[3]中的示例中,脚本使用了PBS的指令来定义任务名称(#PBS -N split_10X_seq_step2)和输出文件的路径(#PBS -o /home/xxzhang/workplace/QBRC/data/fastq/)。然后,脚本使用了ls命令来列出当前目录的文件,并使用python3命令来运行scSplitter.py脚本。
总之,PBS脚本可以用于定义和提交计算任务,并指定任务的名称、所需的资源和要运行的命令。