jupyter操作:graph = nx.from_pandas_edgelist(df,source="from",target="to") nx.degree(graph)之后,怎么将输出结果degreeview前半段作为作为x,后半段值作为y做条形图

时间: 2024-02-27 11:58:21 浏览: 9
可以使用`matplotlib`库来画条形图,具体代码如下: ``` import matplotlib.pyplot as plt # 生成 degreeview 对象 degree_view = nx.degree(graph) # 将 degreeview 对象转换成列表 degree_list = list(degree_view) # 拆分 degree_list 列表,将前半部分作为 x 轴,后半部分作为 y 轴 x = [x[0] for x in degree_list] y = [x[1] for x in degree_list] # 绘制条形图 plt.bar(x, y) # 设置 x 轴标签 plt.xlabel('Node') # 设置 y 轴标签 plt.ylabel('Degree') # 显示图形 plt.show() ``` 其中,`degree_view` 是`nx.degree()`方法的返回值,即一个`degreeview`对象;`degree_list` 是将`degree_view`对象转换成列表的结果,即一个包含元组的列表;`x` 和 `y` 则是将`degree_list`列表拆分成两个列表,分别作为条形图的 x 轴和 y 轴数据。最后使用`plt.bar()`方法绘制条形图,并使用`plt.xlabel()`和`plt.ylabel()`方法设置 x 轴和 y 轴标签,最后使用`plt.show()`方法显示图形。
相关问题

如果不用创建新图,而是根据之前通过代码G = nx.from_pandas_edgelist(df, 'source', 'target','weight', create_using = nx.DiGraph())已导入的数据计算,应该怎么修改呢

如果你已经通过`nx.from_pandas_edgelist`方法将数据导入为图,那么可以直接使用该图进行计算,而无需创建新图。你可以按照以下方式修改代码: ```python import networkx as nx def calculate_yi(graph): yi_values = {} for node in graph.nodes: yi = 0 for neighbor in graph.neighbors(node): wij = graph[node][neighbor]['weight'] si = graph.nodes[node]['strength'] yi += (wij / si) ** 2 yi_values[node] = yi return yi_values # 假设你已经通过nx.from_pandas_edgelist方法导入了图数据为G # 添加节点的强度属性 G.nodes[1]['strength'] = 1.2 G.nodes[2]['strength'] = 0.9 G.nodes[3]['strength'] = 1.5 G.nodes[4]['strength'] = 1.0 # 计算所有yi值 yi_values = calculate_yi(G) print(yi_values) ``` 在这个修改的代码中,我们假设你已经通过`nx.from_pandas_edgelist`方法将数据导入为了图`G`。然后,我们在图的节点上添加了强度属性,并调用`calculate_yi`函数计算所有的yi值。最后,我们打印输出了所有的yi值。请确保在运行代码之前,已经正确导入了图数据。

import pandas as pd import numpy as np import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt # 读取Excel文件中的邻接矩阵 adjacency_matrix = pd.read_excel('output.xlsx', index_col=0) # 将邻接矩阵转换为numpy数组 adjacency_matrix = adjacency_matrix.to_numpy() # 创建有向图对象 G = nx.DiGraph(adjacency_matrix) def preprocess(G): p = 0 directedGraph = nx.DiGraph() for u in G.nodes(): for v in G.neighbors(u): if (v != u): propProb = G.number_of_edges(u, v) / G.degree(v) directedGraph.add_edge(u, v, pp=propProb) return directedGraph def simulate(G, seedNode, propProbability): newActive = True currentActiveNodes = seedNode.copy() newActiveNodes = set() activatedNodes = seedNode.copy() influenceSpread = len(seedNode) while newActive: for node in currentActiveNodes: for neighbor in G.neighbors(node): if neighbor not in activatedNodes: if G[node][neighbor]['pp'] > propProbability: newActiveNodes.add(neighbor) activatedNodes.append(neighbor) influenceSpread += len(newActiveNodes) if newActiveNodes: currentActiveNodes = list(newActiveNodes) newActiveNodes = set() else: newActive = False return influenceSpread def flipCoin(probability): return np.random.random() < probability # 可视化传播过程 def visualizePropagation(G, seedNode, propProbability): pos = nx.spring_layout(G) # 选择布局算法 labels = {node: node for node in G.nodes()} # 节点标签为节点名 colors = ['r' if node in seedNode else 'b' for node in G.nodes()] # 种子节点为红色,其他节点为蓝色 plt.figure(figsize=(10,6)) nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_color=colors) nx.draw_networkx_edges(G, pos) nx.draw_networkx_labels(G, pos, labels) plt.title('Propagation Visualization') plt.show() # 示例用法 seedNode = [7,36,17] propProbability = 0.7 directedGraph = preprocess(G) influenceSpread = simulate(directedGraph, seedNode, propProbability) print("Influence Spread:", influenceSpread) visualizePropagation(directedGraph, seedNode, propProbability)修改这个代码使得输出图形节点之间间隔合理能够看清

你可以尝试修改`nx.spring_layout()`函数的参数,例如`k`,来调整节点之间的距离。这个参数控制着节点之间的斥力大小,较大的`k`值会使节点之间的距离增大,从而使得图形更容易观察。 下面是修改后的代码示例: ```python # 可视化传播过程 def visualizePropagation(G, seedNode, propProbability): pos = nx.spring_layout(G, k=0.5) # 调整k值来改变节点之间的距离 labels = {node: node for node in G.nodes()} # 节点标签为节点名 colors = ['r' if node in seedNode else 'b' for node in G.nodes()] # 种子节点为红色,其他节点为蓝色 plt.figure(figsize=(10,6)) nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_color=colors) nx.draw_networkx_edges(G, pos) nx.draw_networkx_labels(G, pos, labels) plt.title('Propagation Visualization') plt.show() # 示例用法 seedNode = [7,36,17] propProbability = 0.7 directedGraph = preprocess(G) influenceSpread = simulate(directedGraph, seedNode, propProbability) print("Influence Spread:", influenceSpread) visualizePropagation(directedGraph, seedNode, propProbability) ``` 通过调整`k`值,你可以改变节点之间的距离,使得图形更易于观察。可以尝试不同的值来达到最合适的效果。

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import pandas as pd import numpy as np import networkx as nx # 读取Excel文件中的邻接矩阵 adjacency_matrix = pd.read_excel('output.xlsx', index_col=0) # 将邻接矩阵转换为numpy数组 adjacency_matrix = adjacency_matrix.to_numpy() # 创建有向图对象 G = nx.DiGraph(adjacency_matrix) def preprocess(G): p = 0 directedGraph = nx.DiGraph() for u in G.nodes(): for v in G.neighbors(u): if (v != u): # propProb = G.number_of_edges(u, v) / G.in_degree(v) propProb = G.number_of_edges(u, v) / G.degree(v) directedGraph.add_edge(u, v, pp=propProb) # p += propProb # print(propProb) # print('平均阈值:', p/2939) return directedGraph def simulate(G, seedNode, propProbability): newActive = True currentActiveNodes = copy.deepcopy(seedNode) newActiveNodes = set() activatedNodes = copy.deepcopy(seedNode) # Biar ga keaktivasi 2 kali influenceSpread = len(seedNode) while (newActive): for node in currentActiveNodes: for neighbor in G.neighbors( node): # Harus dicek udah aktif apa belom, jangan sampe ngaktifin yang udah aktif if (neighbor not in activatedNodes): if (G[node][neighbor]['pp'] > propProbability): # flipCoin(propProbability) newActiveNodes.add(neighbor) activatedNodes.append(neighbor) influenceSpread += len(newActiveNodes) if newActiveNodes: currentActiveNodes = list(newActiveNodes) newActiveNodes = set() else: newActive = False # print("activatedNodes",len(activatedNodes),activatedNodes) return influenceSpread def flipCoin(probability): return random.random() < probability解释一下这个代码

import networkx as nx import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx import random df=pd.read_csv("D:\级联失效\edges.csv") G=nx.from_pandas_edgelist(df,'from','to',create_using=nx.Graph()) nx.draw(G,node_size=300,with_labels=True) As=nx.adjacency_matrix(G) A=As.todense() def f(x): F=4*x*(1-x) return F n=len(A) r=2 ohxs=0.4 step=10 d=np.zeros([n,step]) for i in range(n): d[i,0]=np.sum(A[i]) x_intial=np.zeros([n,step]) for i in range(n): x_intial[i,0]=random.random() np.set_printoptions(precision=5) h_a=100 H=np.zeros([n,step]) D=np.zeros([n,step]) for i in range(n): Deg=0 for k in range(n): if k!=i: Deg=Deg+d[k,0] D[i,0]=Deg H[i,0]=d[i,0]/D[i,0]/h_a fail_scale=np.zeros(step) fail_scale[0]=1 node_rand_id=random.randint(0,n) r=2 x_intial[node_rand_id,0]=x_intial[node_rand_id,0]+r print(x_intial) fail_node=np.zeros(n) fail_node[node_rand_id]=1 print(fail_node) np.seterr(divide='ignore',invalid='ignore') for t in range(1,step): fail_node_id=[idx for (idx,val) in enumerate(fail_node) if val ==1] for i in range(n): sum=0 for j in range(n): sum = sum+A[i,j]*f(x_intial[j,t-1])/d[i] if i in fail_node_id: x_intial[i,t-1]=0 A[i,:]=0 A[:,i]=0 else: x_intial[i,t]=H[i,t-1]*abs((1-ohxs)*f(x_intial[i,t-1])+ohxs*sum) d[i,t]=np.sum(A[i]) Deg=0 for k in range(n): if k!=i: Deg=Deg+d[i,t] D[i,t]=Deg H[i,t]=d[i,t]/D[i,t]/h_a new_fail_id=[idx for (idx,val) in enumerate(x_intial[:,t]) if val>=1] fail_scale[t]=fail_scale[t-1]+len(new_fail_id) fail_node[new_fail_id]=1 x_intial[new_fail_id,t]=x_intial[new_fail_id,t]+r print(H[i,t]) print(fail_node) print(x_intial) plt.plot(fail_scale) plt.show()

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好的,根据上面的目标函数,我们可以推导出其对应的梯度向量函数,如下所示: def gradient(x, y, beta): """ Compute gradient of the logistic regression loss function :param beta: model parameter vector :param x: feature matrix :param y: label vector :return: gradient vector """ n = x.shape[0] pred = 1 /
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