对不同 gene_type 统计各 length 分布,绘制箱型图;统计数目最多的5种,绘制饼图; 以300dpi保存为pdf文件。python pandas
时间: 2023-11-27 15:54:44 浏览: 90
《Python数据分析与应用》实验二 pandas统计分析基础.pdf
以下是可能的代码实现:
```python
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# 读取数据
df = pd.read_csv('data.csv')
# 统计各 gene_type 和 length 的数量
counts = df.groupby(['gene_type', 'length']).size().reset_index(name='count')
# 绘制箱型图
fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 6), dpi=300)
counts.boxplot(column='count', by='length', ax=ax)
ax.set_xlabel('Length')
ax.set_ylabel('Count')
ax.set_title('Distribution of Counts by Length')
plt.savefig('boxplot.pdf')
# 统计数目最多的5种 gene_type
top_5 = df['gene_type'].value_counts().head(5)
# 绘制饼图
fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 6), dpi=300)
ax.pie(top_5.values, labels=top_5.index, autopct='%1.1f%%')
ax.set_title('Top 5 Gene Types')
plt.savefig('piechart.pdf')
```
其中,`data.csv` 是数据文件,包含 `gene_type` 和 `length` 两列。第一个部分统计各 `gene_type` 下各 `length` 的数量,并绘制箱型图;第二个部分统计数目最多的5种 `gene_type`,并绘制饼图。最后两个部分的结果分别保存为 `boxplot.pdf` 和 `piechart.pdf` 文件。注意,使用 `dpi` 参数来指定保存的文件分辨率。
阅读全文