plotly生成的交互图表在Rmd中会报错
时间: 2023-11-23 21:07:19 浏览: 68
rsparklificator:在 Rmd 文档中使用 sparklificator 的简单函数
如果在R Markdown中使用`plotly`包生成交互图表,可能会出现报错情况。这是因为`plotly`包生成的图表是基于JavaScript实现的交互式图表,需要额外的设置才能在R Markdown中正确输出。
要在R Markdown中使用`plotly`包生成交互图表,可以按照以下步骤进行设置:
1. 在R Markdown文档的顶部添加以下代码,加载`plotly`包并设置输出选项:
```
```{r setup, include=FALSE}
library(plotly)
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE, message = FALSE, warning = FALSE, fig.width=6, fig.height=4, cache=TRUE)
```
```
在上面的代码中,首先使用`library()`函数加载`plotly`包。然后,使用`knitr::opts_chunk$set()`函数设置`fig.width`和`fig.height`参数,并将`cache`参数设置为`TRUE`以缓存图表数据。
2. 在代码块中使用`plot_ly()`函数生成交互图表,例如:
```
```{r}
# 生成一个交互图表
plot_ly(mtcars, x = ~wt, y = ~mpg, color = ~cyl, size = ~hp)
```
```
在上面的代码中,使用`plot_ly()`函数生成一个交互图表。需要注意的是,`plot_ly()`函数生成的图表不需要使用`print()`函数输出。
3. 在代码块中使用`htmlwidgets::saveWidget()`函数将交互图表保存为一个html文件,例如:
```
```{r}
# 生成一个交互图表
p <- plot_ly(mtcars, x = ~wt, y = ~mpg, color = ~cyl, size = ~hp)
# 将交互图表保存为一个html文件
htmlwidgets::saveWidget(p, "myplot.html")
```
```
在上面的代码中,首先使用`plot_ly()`函数生成一个交互图表,并将其保存为变量`p`。然后,使用`htmlwidgets::saveWidget()`函数将变量`p`保存为一个html文件。
以上步骤可以在R Markdown中正确输出`plotly`包生成的交互图表。需要注意的是,在输出交互图表时,需要将R Markdown文档的输出格式设置为`html_document`。例如:
```
---
title: "My R Markdown Document"
output: html_document
---
```
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