cicrle RNA 注释
时间: 2023-09-03 10:16:25 浏览: 73
Circle RNA注释是指对环状RNA(circular RNA)进行注释的过程。环状RNA是一种闭合的RNA分子,其两个末端通过连接形成一个环状结构,相较于线性RNA具有更稳定的结构。Circle RNA注释的目的是对这些环状RNA进行功能和结构的解析。
一个用于环状RNA注释的工具是基于轻型Aho-Corasick算法的RNA@。该算法将核苷酸序列的数据集编码到有限状态机中,能够在基因组的单次读取中识别基因组中每个核苷酸序列的每次出现。通过使用RNA@工具,可以对环状RNA进行全面的注释和分析。
此外,miRTOP(miRNA Transcriptome Open Project)是一个小型RNA标准注释项目,该项目提供了关于miRNA转录组的开放数据和相关注释信息。miRTOP项目可以为研究人员提供了解环状RNA的转录组表达和功能的机会。
总而言之,Circle RNA注释是对环状RNA进行功能和结构解析的过程,其中使用了RNA@等工具进行注释和分析。此外,miRTOP项目也提供了相关的开放数据和注释信息供研究人员使用。<span class="em">1</span><span class="em">2</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* [RNA@:RNA注释工具-开源](https://download.csdn.net/download/weixin_42118423/19662054)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
- *2* [miRTOP.github.io:小型RNA标准注释项目](https://download.csdn.net/download/weixin_42144201/16730629)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
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