lammps运行中断，怎么续跑文件

LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一个流行的分子模拟软件，如果运行过程中遇到中断，想要继续处理之前的数据，你可以按照以下步骤操作：

1. **检查日志文件**：首先查看LAMMPS的日志文件（通常命名为.lammpstrj.log），找出导致中断的原因，可能是内存溢出、计算错误或是系统崩溃。

2. **保存中间状态**：在中断前，LAMMPS通常会保存一个中间状态文件（.restart）。这个文件包含了模拟的状态信息，如粒子的位置、速度等。

3. **恢复运行**：在命令行中，使用`lmp <your_input_file>`命令，然后加上`-in restart`选项，指定要用的中间状态文件作为输入。例如：

   lmp -in input.restart

4. **调整资源限制**：如果上次中断是因为资源限制，比如内存不足，你需要修改你的运行配置文件（默认的.input或.spec），增加足够的资源。

5. **手动处理部分数据**：有些情况可能需要手动处理，比如在分子动力学模拟中，如果你错过了一些时间步，可能需要手动插入那些步长的数据。

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lammps运行近场动力学的案例in文件

以下是一个 LAMMPS 中使用近场动力学方法进行模拟的示例输入文件：

# 近场动力学模拟输入文件

# 初始化
units lj
atom_style meso
dimension 2
boundary p p f

# 定义材料属性
region whole block 0 10 0 10 INF INF
create_box 1 whole
create_atoms 1 region whole
mass 1 1.0

# 定义近场动力学属性
neighbor 0.3 meso
neigh_modify every 1 delay 0 check no
communicate single meso

# 定义力场
pair_style meso table linear 1000
pair_coeff * *

# 定义运动方程
fix 1 all nve/sphere

# 定义输出
thermo_style custom step temp pe etotal
thermo 1000

# 运行
run 10000

该输入文件将在一个 10x10 的矩形区域内模拟一个材料的近场动力学行为。其中，使用了 LAMMPS 中的 meso 原子样式，表示使用近场动力学方法进行模拟；pair_style meso 表示使用近场动力学力场；fix 1 all nve/sphere 定义了运动方程；thermo_style custom step temp pe etotal 定义了输出信息，包括步数、温度、势能、总能量等。

在运行 LAMMPS 时，使用以下命令来运行上述输入文件：

lammps -in input_file.in

其中，input_file.in 是你的输入文件名。

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