d3js 实现Dendrogram

d3.js是一个强大的JavaScript库，用于创建数据驱动的文档，常用于数据可视化。Dendrogram（聚类图），是一种树形结构表示，广泛应用于生物信息学、社会科学等领域，用于展示数据集的相似性或层次关系。在d3.js中，你可以通过以下步骤实现一个简单的Dendrogram：

1. **准备数据**：首先需要有包含距离矩阵或相似度评分的数据。每个节点通常由两个值表示：一个是节点ID，另一个是它与其他节点的距离。

2. **加载d3.js**：在HTML文件中引入d3.min.js库。

3. **选择容器**：使用`d3.select()`选择HTML元素作为图形容器。

const svg = d3.select('body').append('svg')

4. **设置视口**：定义SVG的大小和比例尺。

const width = 600;
const height = 400;
const margin = {top: 20, right: 20, bottom: 20, left: 20};
const innerWidth = width - margin.left - margin.right;
const innerHeight = height - margin.top - margin.bottom;

const svg = d3.select('body').append('svg')
  .attr('width', width)
  .attr('height', height);

5. **计算布局**：使用d3-hierarchy（一个d3包）将数据转换成树形结构，并计算布局。`d3.cluster()`, `d3.tree()` 或者自定义函数可以派上用场。

import * as d3Hierarchy from 'd3-hierarchy';

const dendrogramData = ...; // 加载或处理数据
const root = d3Hierarchy.tree(dendrogramData);

const treeLayout = d3_hierarchy.cluster()
  .size([innerWidth, innerHeight]);
root.each(treeLayout);

6. **绘制树枝和节点**：遍历布局结果，绘制各个节点及其连线。

function drawNode(node) {
  const x = node.x,
        y = node.y;

  // 绘制节点
  const rect = g.append('rect')
    .datum(node)
    .attr('x', x)
    .attr('y', y)
    .attr('width', 10)
    .attr('height', 10);

  if (node.children) {
    // 绘制分支连线
    rect.append('title')
      .text(() => node.data.label);
    rect.append('descendant')
      .attr('dx', 12)
      .attr('dy', 8)
      .attr('transform', `rotate(${Math.PI / 2})`);
    
    // 递归绘制子节点
    node.children.forEach(drawNode);
  }
}

drawNode(root);

7. **添加交互**：如果你希望用户能交互（如点击缩放或展开折叠），你可以添加事件监听器和适当的动画效果。

这只是一个基本框架，实际应用中可能还需要调整样式、添加轴标签等细节。